15N relaxation and quantification of 15N labelled metabolites in cell extracts - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Comptes Rendus. Chimie Année : 2006

15N relaxation and quantification of 15N labelled metabolites in cell extracts

C. Pau-Roblot
A. Roscher

Résumé

15N is useful for studying nitrogen metabolism by isotope labelling. However, the 15N NMR analysis is hampered by negative nOe factors and sometimes long T 1 values. Moreover, these can have a marked dependency on their physico-chemical environment (pH, ionic charge, viscosity, etc.) making quantitative analysis of cell extracts from labelling experiments difficult. We have, therefore, analysed some of these dependencies in order to find conditions in which quantitative analysis of some major metabolites (amino acids, ammonium, nitrate, urea) can be performed reliably and with sufficient signal.
Le 15N est bien adapté pour étudier le métabolisme azoté par marquage isotopique. Cependant, l’analyse par RMN 15N est gênée par des facteurs nOe négatifs et certains T1 longs. De plus, les deux peuvent dépendre de manière prononcée de l’environnement physicochimique (pH, charge ionique, viscosité, etc.) ce qui rend difficile l’analyse quantitative d’extraits cellulaires. Nous avons donc analysé quelques-unes de ces dépendances pour trouver des conditions dans lesquelles une analyse quantitative de quelques métabolites majeurs (acides aminé, ammonium, nitrate, urée) peut être réalisée d’une manière fiable et avec suffisamment de signal.

Dates et versions

hal-00071183 , version 1 (23-05-2006)

Identifiants

Citer

N. Houyou, C. Pau-Roblot, A. Roscher. 15N relaxation and quantification of 15N labelled metabolites in cell extracts. Comptes Rendus. Chimie, 2006, 9, pp.520-524. ⟨10.1016/j.crci.2005.06.029⟩. ⟨hal-00071183⟩
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