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A new framework for shallow approximations of incompressible flows

 Nathan Shourick , Ibrahim Cheddadi , Pierre Saramito
2023
Pré-publication, Document de travail hal-04062098v1
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Deep learning: step forward to high-resolution in vivo shortwave infrared imaging

 Vladimir A Baulin , Yves Usson , Xavier Le Guével
Journal of Biophotonics, 2021, 14 (7), ⟨10.1002/jbio.202100102⟩
Article dans une revue hal-03373533v1
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Searching for the Metabolic Signature of Cancer: A Review from Warburg’s Time to Now

 Pierre Jacquet , Angélique Stéphanou
Biomolecules, 2022, 12 (10), pp.1412. ⟨10.3390/biom12101412⟩
Article dans une revue hal-03813369v1

Epigenetic Alterations of Maternal Tobacco Smoking during Pregnancy: A Narrative Review

 Aurélie Nakamura , Olivier François , Johanna Lepeule
International Journal of Environmental Research and Public Health, 2021, 18 (10), pp.5083. ⟨10.3390/ijerph18105083⟩
Article dans une revue hal-03424187v1
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Dynamical modeling of the H3K27 epigenetic landscape in mouse embryonic stem cells

 Kapil Newar , Amith Zafal Abdulla , Hossein Salari , Eric Fanchon , Daniel Jost
PLoS Computational Biology, 2022, 18, ⟨10.1371/journal.pcbi.1010450⟩
Article dans une revue hal-03431877v1
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DECONbench: a benchmarking platform dedicated to deconvolution methods for tumor heterogeneity quantification

 Clémentine Decamps , Alexis Arnaud , Florent Petitprez , Mira Ayadi , Aurélia Baurès , et al.
BMC Bioinformatics, 2021, 22 (1), pp.473. ⟨10.1186/s12859-021-04381-4⟩
Article dans une revue hal-03372668v1
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Migration of cancer cells in 3D collagen medium

 L Laforgue , A Fertin , Y Usson , Claude Verdier , V M Laurent
Congrès Société de Biomécanique 2021, Oct 2021, Saint-Etienne, France
Communication dans un congrès hal-03249984v1
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Statistiques bayésiennes en génétique des populations : modèle à facteurs et processus gaussiens pour étudier la variation génétique neutre et adaptative

 Nicolas Duforet-Frebourg
Génétique des populations [q-bio.PE]. Université de Grenoble, 2014. Français. ⟨NNT : 2014GRENS015⟩
Thèse tel-01558168v1
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Reduction and Fixed Points of Boolean Networks and Linear Network Coding Solvability

 Maximilien Gadouleau , Adrien Richard , Eric Fanchon
IEEE Transactions on Information Theory, 2016, 62 (5), pp.2504-2519. ⟨10.1109/TIT.2016.2544344⟩
Article dans une revue hal-01318072v1
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Genome organization via loop extrusion, insights from polymer physics models

 Surya Ghosh , Daniel Jost
Briefings in Functional Genomics and Proteomics, 2020, 19 (2), pp.119-127. ⟨10.1093/bfgp/elz023⟩
Article dans une revue hal-03012763v1

Individuality of breathing during volitional moderate hyperventilation

 Tudor Besleaga , Michael Blum , Raphael Briot , Victor Vovc , Ion Moldovanu , et al.
European Journal of Applied Physiology, 2016, 116 (1), pp.217-225. ⟨10.1007/s00421-015-3260-3⟩
Article dans une revue hal-02075476v1
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Méthodologie semi-formelle pour l’étude de systèmes biologiques : application à l'homéostasie du fer

 Nicolas Mobilia
Hématologie. Université Grenoble Alpes, 2015. Français. ⟨NNT : 2015GREAS042⟩
Thèse tel-01561060v1

Genome scan methods against more complex models: when and how much should we trust them?

 Pierre de Villemereuil , Eric Frichot , Eric Bazin , Olivier François , Oscar Gaggiotti
Molecular Ecology, 2014, 23 (8), pp.2006-2019
Article dans une revue hal-02004812v1
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Formal methods for modelling and validation of biological models

 Alexandre Rocca
Mathematical Physics [math-ph]. Université Grenoble Alpes, 2018. English. ⟨NNT : 2018GREAM028⟩
Thèse tel-01913296v1

Producing a set of models for the iron homeostasis network

 Nicolas Mobilia , Alexandre Donzé , Jean-Marc Moulis , Eric Fanchon
Proceedings Second International Workshop on Hybrid Systems and Biology (HBS 2013), Thao Dang and Carla Piazza, Sep 2013, Taormina, Italy. pp.92-98, ⟨10.4204/EPTCS.125.7⟩
Communication dans un congrès hal-01936055v1

Extracellular Vesicles from 50,000 Generation Clones of the Escherichia coli Long-Term Evolution Experiment

 David Laurin , Corinne Mercier , Nyamekye Quansah , Julie Suzanne Robert , Yves Usson , et al.
International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23 (23), pp.14580. ⟨10.3390/ijms232314580⟩
Article dans une revue hal-03893516v1
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Inference of population genetic structure from temporal samples of DNA

 Olivier François , Séverine Liégeois , Benjamin Demaille , Flora Jay
2019
Pré-publication, Document de travail hal-02413974v1

IC-Finder: inferring robustly the hierarchical organization of chromatin folding

 Noelle Haddad , Cédric Vaillant , Daniel Jost
Nucleic Acids Research, 2017, 45 (10), pp.gkx036. ⟨10.1093/nar/gkx036⟩
Article dans une revue hal-01976542v1

Perspectives: using polymer modeling to understand the formation and function of nuclear compartments

 N. Haddad , D. Jost , C. Vaillant
Chromosome Research, 2017, 25 (1), pp.35-50
Article dans une revue hal-01976574v1

HepatoDyn: A Dynamic Model of Hepatocyte Metabolism That Integrates 13C Isotopomer Data

 Carles Foguet , Silvia Marin , Vitaly A. Selivanov , Eric Fanchon , Wai-Nang Paul Lee , et al.
PLoS Computational Biology, 2016, 12 (4), pp.e1004899. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004899⟩
Article dans une revue hal-02270695v1

Experience Feedback Committee: a management tool to improve patient safety in mental health

 Bastien Boussat , Thierry Bougerol , Olivier Detante , Arnaud Seigneurin , Patrice François
Annals of General Psychiatry, 2015, 14 (1), ⟨10.1186/s12991-015-0062-2⟩
Article dans une revue hal-02271185v1

Breastfeeding Assessment Score: Systematic Review and Meta-analysis

 T. Raskovalova , S.L. Teasley , N. Gelbert-Baudino , P.A. Mauri , C. Schelstraete , et al.
Pediatrics, 2015, 135 (5), pp.e1276-e1285. ⟨10.1542/peds.2014-3072⟩
Article dans une revue hal-02271137v1

Reconstruction automatique de formulaires d’enquête médicale sur la culture de sécurité des patients par une méthode de factorisation matricielle bayésienne

 B. Don Bosco Diatta , Papa Ngom , Bastien Boussat , Olivier François
Journal de la Société Française de Statistique, 2018, 159 (2), pp.111-127
Article dans une revue hal-02272001v1

Looking at hospitalized persons throughout the prism of the handicap

 M. Giral , B. Boussat , F. Lombard , S. Stempfle , P. François , et al.
Annals of Physical and Rehabilitation Medicine, 2018, 61 (1), pp.12-17. ⟨10.1016/j.rehab.2017.03.001⟩
Article dans une revue hal-02272023v1

Blunt splenic injury: are early adverse events related to trauma, nonoperative management, or surgery?

 Julien Frandon , Mathieu Rodiere , Catherine Arvieux , Anne Vendrell , Bastien Boussat , et al.
Diagnostic and Interventional Radiology, 2015, 21 (4), pp.327-333. ⟨10.5152/dir.2015.14800⟩
Article dans une revue hal-02271241v1
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Bi-allelic Mutations in ARMC2 Lead to Severe Astheno-Teratozoospermia Due to Sperm Flagellum Malformations in Humans and Mice

 C. Coutton , G. Martinez , Z.-E. Kherraf , A. Amiri-Yekta , M. Boguenet , et al.
American Journal of Human Genetics, 2019, 104 (2), pp.331-340. ⟨10.1016/j.ajhg.2018.12.013⟩
Article dans une revue hal-02003335v1

The contribution of open comments to understanding the results from the Hospital Survey on Patient Safety Culture (HSOPS): A qualitative study

 Bastien Boussat , Kevin Kamalanavin , Patrice François
PLoS ONE, 2018, 13 (4), pp.e0196089. ⟨10.1371/journal.pone.0196089⟩
Article dans une revue hal-02270772v1
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Effectiveness of a Multifaceted Informational-Based and Text Message Reminders on Pneumococcal and Influenza Vaccinations in Hospital Emergency Departments: A Cluster-Randomized Controlled Trial

 Sarah Tubiana , José Labarere , Jacques Levraut , Pierre Michelet , Fleur Jourda de Vaux , et al.
Vaccines, 2021, 9 (9), pp.962. ⟨10.3390/vaccines9090962⟩
Article dans une revue hal-03354283v1

Robustness analysis and behavior discrimination in enzymatic reaction networks.

 Alexandre Donzé , Eric Fanchon , Lucie Martine Gattepaille , Oded Maler , Philippe Tracqui
PLoS ONE, 2011, 6 (9), pp.e24246. ⟨10.1371/journal.pone.0024246⟩
Article dans une revue hal-00846753v1

Regional system of care for ST-segment elevation myocardial infarction in the Northern Alps: a controlled pre- and postintervention study.

 José Labarère , Loic Belle , Magali Fourny , Gérald Vanzetto , Guillaume Debaty , et al.
Archives of cardiovascular diseases, 2012, 105 (8-9), pp.414-23. ⟨10.1016/j.acvd.2012.05.001⟩
Article dans une revue hal-00843358v1
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