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Theoretical Biology Insights 1 (2008) 13--22
From Molecules to Organisms: Towards Multiscale Integrated Models of Biological Systems
Christophe Lavelle 1, 2, 3, Hugues Berry 4, Guillaume Beslon 5, Francisco Ginelli 6, Jean-Louis Giavitto 7, Zoi Kapoula 8, André Le Bivic 9, 10, Nadine Peyrieras 11, 12, Ovidiu Radulescu 13, 14, Adrien Six 15, Véronique Thomas-Vaslin 16, Paul Bourgine 17
(2008)

A consensus has recently emerged that further progress in understanding human physiopathology will demand integrative views of biological systems. In this context, complex systems and related interdisciplinary approaches of biology are expected to help. The aim of this collective paper is basically to provide a starting point for further discussions and interactions within the community of complex systems biologists. After briefly introducing some general concepts, we present four major challenges that should be tackled in the next years. These represent future directions that we isolated as priority concerns for modern biology. Suggestions of how to reach these destinations are provided, with the hope that they will soon lead to concrete advances towards fully consistent multiscale models of biological systems and a better understanding of physiopathology.
1 :  Institut Gustave Roussy (IGR)
Institut Gustave Roussy
2 :  Institut Jacques Monod (IJM)
CNRS : UMR7592 – Université Paris VII - Paris Diderot
3 :  Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée (LPTMC)
CNRS : UMR7600 – Université Pierre et Marie Curie [UPMC] - Paris VI
4 :  AMIB (INRIA Saclay - Ile de France)
INRIA – Polytechnique - X – CNRS : UMR8623 – Université Paris XI - Paris Sud
5 :  COMBINING (LIRIS / INRIA Grenoble Rhône-Alpes / INSA Lyon / UCB Lyon)
INRIA – Université Claude Bernard - Lyon I – Laboratoire d'informatique en Image et Systèmes d'Information – CNRS : UMR5205 – Institut National des Sciences Appliquées (INSA) - Lyon
6 :  Service de physique de l'état condensé (SPEC)
CNRS : URA2464 – CEA : DSM/IRAMIS
7 :  Informatique, Biologie Intégrative et Systèmes Complexes (IBISC)
CNRS : FRE3190 – Université d'Evry-Val d'Essonne
8 :  Centre d'étude de la SensoriMotricité (CESEM)
Université Paris V - Paris Descartes – CNRS : UMR8194 – Université Paris VII - Paris Diderot
9 :  NMDA : Neurogenèse et morphogenèse dans le développement et chez l'adulte (NNMDDCA)
CNRS : UMR6156 – Université de la Méditerranée - Aix-Marseille II
10 :  Institut de Biologie du Développement de Marseille Luminy (IBDML)
CNRS : UMR6216 – Université de la Méditerranée - Aix-Marseille II
11 :  Développement, évolution et plasticité du système nerveux (DEPSN)
CNRS : UPR2197
12 :  Institut de Neurobiologie Alfred Fessard (INAF)
CNRS : FRC2118
13 :  SYMBIOSE (INRIA - IRISA)
CNRS : UMR6074 – INRIA – Institut National des Sciences Appliquées (INSA) - Rennes – Université de Rennes 1
14 :  Institut de Recherche Mathématique de Rennes (IRMAR)
CNRS : UMR6625 – Université de Rennes 1 – École normale supérieure de Cachan - ENS Cachan – Institut National des Sciences Appliquées (INSA) : - RENNES – Université de Rennes II - Haute Bretagne
15 :  Immunophysiopathologie Infectieuse
CNRS : UMR1961 – Institut Pasteur de Paris
16 :  Biologie et thérapeutique des pathologies immunitaires (BTPI)
CNRS : UMR7087 – Université Pierre et Marie Curie [UPMC] - Paris VI
17 :  Centre de recherche en épistémologie appliquée (CREA)
CNRS : UMR7656 – Polytechnique - X
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