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Studies focusing on the effect of invasive species on the genetic diversity of native marine invertebrates remain scant. Here we report diversity among French populations of the intertidal gastropod Ocenebra erinacea (Linnaeus, 1758) sampled in the presence and absence of the invasive Ocenebra inornata (Recluz, 1851). Between 1999 and 2004, a total of 352 individuals of O. erinacea was collected from 15 sites, five of which had the invasive present, and genotyped at the mitochondrial locus cox1. No statistical difference was observed between polymorphism levels recorded within native populations exposed to the invasive, compared with populations sampled in the absence of O. inornata. No sign of native population decline was detected in response to the invader. While significant shifts in native O. erinacea population sizes have previously been reported in the literature, genetic effects may take longer to accumulate, or may be undetectable without a larger panel of genetic markers. By contrast, large genetic distances and significant population differentiation were recorded between Atlantic and Mediterranean O. erinacea samples, suggesting that these populations have distinct evolutionary histories. Comparison of genetic divergence within the closely related genus Nucella suggests that the Atlantic populations of O. erinacea and those from Thau Lagoon in the Mediterranean may belong to different species or subspecies.
RAD-tag sequencing is a promising method for conducting genome-wide evolutionary studies. However, to date, only a handful of studies empirically tested its applicability above the species level. In this communication, we use RAD-tags to contribute to the delimitation of species within a diverse genus of deep-sea octocorals, Chrysogorgia, for which few classical genetic markers have proved informative. Previous studies have hypothesized that single mitochondrial haplotypes can be used to delimit Chrysogorgia species. Based on two lanes of Illumina sequencing, we inferred phylogenetic relationships among twelve putative species that were delimited using mitochondrial data, comparing two RAD analysis pipelines (Stacks and pyRAD). The number of homologous RAD loci decreased dramatically with increasing divergence, as >70% of loci are lost when comparing specimens separated by two mutations on the 700 nt long mitochondrial phylogeny. Species delimitation hypotheses based on the mitochondrial mtMutS gene are largely supported, as six out of nine putative species represented by more than one colony were recovered as discrete, well-supported clades. Significant genetic structure (correlating with geography) was detected within one putative species, suggesting that individuals characterized by the same mtMutS haplotype may belong to distinct species. Conversely, three mtMutS haplotypes formed one well-supported clade within which no population structure was detected, also suggesting that intra-specific variation exists at mtMutS in Chrysogorgia. Despite an impressive decrease in the number of homologous loci across clades, RAD data helped us to fine-tune our interpretations of classical mitochondrial markers used in octocoral species delimitation, and discover previously undetected diversity.
In the ice cream industry, the type of final desired product (large cartons (sqrounds) or ice creams on a stick) determine the viscosity at which the ice cream has to be produced. One of the objectives of the ice cream crystallization processes is therefore to produce an ice cream of specified viscosity. In this paper, a nonlinear control strategy is proposed for the control of the viscosity of the ice cream in a continuous crystallizer. It has been designed on the basis of a reduced order model obtained by application of the method of moments, on a population balance equation describing the evolution of the crystal size distribution. The control strategy is based on a linearizing control law coupled with a Smith predictor to account for the measurement delay. It has been validated on a pilot plant located at IRSTEA (Antony, France).
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