Identification des liens entre communautés associées au cycle de l'azote par méthode d'enrichissement isotopique: Application aux zones d'interfaces aérobie/anaérobie des sédiments marins
Résumé
Le cycle de l'azote joue un rôle important dans le fonctionnement des écosystèmes en contrôlant le degré d'eutrophisation. La compréhension des flux biogéochimiques nécessite l'indentification et la mesure de l'intensité des processus sous-jacent. Les méthodes isotopiques basées sur l'enrichissement en 15N permettent de suivre le devenir d'un substrat et de discriminer par exemples le N2 produit par denitrification ou par Anammox ; les relations entre la nitrification (production de nitrate/nitrite) et la dénitrification (consommation de nitrate/nitrite) ; ainsi que la balance entre élimination de nitrate (denitrification ) et son recyclage en ammonium (RDNA, Dissimilative Reduction du nitrate en ammonium). Cette approche sera illustrée par l'étude du cycle de l'azote dans des sédiments marins méditerranéens (golfe de Fos, Etang de Berre) et de mangrove (Goa, Inde) impactés différemment par des activités anthropiques telles que la conchyliculture, des variations de salinité ou des rejets de mines. En parallèle, les communautés procaryotiques, acteurs de ses processus peuvent être appréhendées grâce aux suivis de leurs gènes fonctionnels caractéristiques. Cette approche sera illustrée par une étude de l'impact des variations de la salinité sur les processus du cycle de l'azote, à partir de microcosmes contenant du sédiment de l'étang de Berre. Face aux perturbations, la dénitrification et la nitrate réduction ont présenté une résistance plus importante que la nitrification pour laquelle des shifts de communautés ont été identifiés. Néanmoins, la réponse des écosystèmes aux variations de salinité semble dépendante de stress antérieurs à long terme, précédemment supporté par les communautés naturelles sédimentaires