Finding spot shape in cdna microarray by using a deformable grid and a Markov segmentation

Christophe Gouinaud (1) , David R.C. Hill (1) , Pierre Peyret (2) , Loïc Yon (1)

1 LIMOS - Laboratoire d'Informatique, de Modélisation et d'optimisation des Systèmes
2 LMGE - Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement

L'intérêt de l'utilisation des biopuces cdna pour la génétique n'est plus à démontrer [EISE-99]. Cette technologie complexe arrive maintenant à une certaine maturité et son utilisation s'étend notamment dans la modélisation des relations gène expression individu. De ce fait, le défi actuel est l'amélioration de la précision des mesures réalisées de fac¸on à augmenter la qualité des expressions estimées et donc les résultats fonctionnels. En effet, le plus souvent les réponses cherchées jusqu'à présent étaient binaires, alors que maintenant la recherche s'oriente vers des mesures moins tranchées où l'on veut mesurer un quantum d'expression.

Domaines: Recherche opérationnelle [math.OC]

Christophe Gouinaud, David R.C. Hill, Pierre Peyret, Loïc Yon. Finding spot shape in cdna microarray by using a deformable grid and a Markov segmentation. 2009. ⟨hal-00678560⟩