Estimation de la concentration d'un agent biologique par détection de rupture sur vidéos de fluorescences issues de PCR
Résumé
L'estimation de la concentration d'un agent pathologique est une étape primordiale pour déclencher une alerte en cas de menace biologique. En appliquant une PCR associée à un marqueur fluorescent sur un échantillon à analyser, nous observons une émission lumineuse qui est fonction de la concentration de l'agent. Cette concentration est alors déduite du nombre de cycles de réaction à partir duquel la fluorescence change de comportement. Dans le cadre du projet GENEASE, nous proposons d'utiliser une méthode de détection de rupture, le \cusum, qui estime ce nombre de cycles. Nous comparons ces résultats à ceux trouvés par la méthode du maximum de la dérivée seconde, méthode qui est utilisée dans les appareils industriels et des laboratoires. Nous obtenons des résultats comparables, mais contrairement à cette dernière, sans disposer du signal complet et en minimisant le retard à la détection
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)
Loading...