OpenElectrophy : un logiciel libre pour l'analyse de signaux electrophysiologiques

Samuel Garcia (1) , Nicolas Fourcaud-Trocmé (1)

1 Neurosciences Sensorielles Comportement Cognition

Les techniques expérimentales récentes permettent d'acquérir de grandes quantités de données. Le stockage et le traitement efficace de ces données est donc désormais une question fondamentale. Dans ce cadre, nous avons développé le logiciel libre OpenElectrophy initalement concu pour traiter des données électrophysiologiques, écrit avec le langage libre python et notamment le module scientifique SciPy. Il s'interface avec une base de données MySQL permettant le stockage complet sur le long terme des signaux expérimentaux, des conditions expérimentales et du traitement des données. Le logiciel inclut par ailleurs plusieurs outils permettant de détecter et analyser les spikes et oscillations des différents signaux. Enfin, la nature libre du logiciel ainsi que sa construction modulaire permettent une amélioration rapide et constante de ses fonctions et l'utilisation de ses scripts internes par des programmes auxiliaires avec une trés grande souplesse.

Mots clés: Data analysis; Spiking neurons

Domaines: Neurosciences [q-bio.NC]; Neurosciences

Samuel Garcia, Nicolas Fourcaud-Trocmé. OpenElectrophy : un logiciel libre pour l'analyse de signaux electrophysiologiques. Deuxième conférence française de Neurosciences Computationnelles, "Neurocomp08", Oct 2008, Marseille, France. ⟨hal-00331542⟩