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Physical Review Letters 102, 6 (2009) 068104
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Oscillations in the expression of a self-repressed gene induced by a slow transcriptional dynamics
Pierre-Emmanuel Morant 1, Quentin Thommen 1, François Lemaire 2, 3, Constant Vandermoëre 1, Benjamin Parent 4, 5, Marc Lefranc ( ) 1, 5
(13/02/2009)

We revisit the dynamics of a gene repressed by its own protein in the case where the transcription rate does not adapt instantaneously to protein concentration but is a dynamical variable. We derive analytical criteria for the appearance of sustained oscillations and find that they require degradation mechanisms much less nonlinear than for infinitely fast regulation. Deterministic predictions are also compared with stochastic simulations of this minimal genetic oscillator.
1 :  Physique des Lasers, Atomes et Molécules (PhLAM)
CNRS : UMR8523 – Université Lille 1 - Sciences et Technologies
2 :  Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille (LIFL)
CNRS : UMR8022 – INRIA – IRCICA – Université Lille 1 - Sciences et Technologies
3 :  CALFOR (LIFL)
Université Lille 1 - Sciences et Technologies – CNRS : UMR8022
4 :  Unité de Glycobiologie structurale et fonctionnelle (UGSF)
CNRS : UMR8576 – Université Lille 1 - Sciences et Technologies
5 :  Institut de Recherche Interdisciplinaire (IRI)
CNRS : USR3078 – Université Lille 1 - Sciences et Technologies – Université du Droit et de la Santé - Lille II
Sciences du Vivant/Bio-Informatique, Biologie Systémique

Informatique/Bio-informatique

Sciences du Vivant/Biochimie, Biologie Moléculaire/Réseaux moléculaires
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