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FEMS microbiology letters, 261 (2006) 25-31
Isolationand characterization of functional insertion sequences of rhizobia
Ismael Hernandez-Lucas 1, Jose Augusto Ramirez-Trujillo 1, Miguel Angel Gaitan 1, Xianwu Guo 2, Margarita Flores 2, Esperanza Martinez-Romero 2, Ernesto Perez-Rueda 1, Patrick Mavingui 3
(2006)

Rhizobia are a group of bacteria that form nodules on the roots of legume host plants. The sequenced genomes of the rhizobia are characterized by the presence of many putative insertion sequences (IS) elements. However, it is unknown whether these IS elements are functional and it is therefore relevant to assess their transposition activity. In this work, several functional insertion sequences belonging to the IS1256, IS3, IS5, IS166, and IS21 families were captured from Rhizobium tropici, Rhizobium sp. NGR234 and Sinorhizobium meliloti, using pGBG1 as a trapping system. In silico analysis shows that homologs of rhizobia mobile elements are present in distantly related genomes, suggesting that Rhizobium IS elements are prone to genetic transfer.
1 :  Departamento de Microbiologia Molecular Instituto de Biotecnologia
UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO
2 :  Centro de Ciencias Genomicas
UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO
3 :  Ecologie microbienne (EM)
CNRS : UMR5557 – INRA : UR1193 – Université Claude Bernard - Lyon I – Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon
4
Sciences du Vivant/Biochimie, Biologie Moléculaire/Génomique, Transcriptomique et Protéomique
rhizobia – insertion sequences – transposition.

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