2023

Article dans une revue

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Jürgen Dengler, Florian Jansen, Olha Chusova, Elisabeth Hüllbusch, Michael P Nobis, et al.. Ecological Indicator Values for Europe (EIVE) 1.0. Vegetation Classification and Survey, 2023, 4, pp.7-29. ⟨10.3897/VCS.98324⟩. ⟨hal-03943422⟩

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Chapitre d'ouvrage

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François Gillet. Prédire le futur des écosystèmes jurassiens… est-ce raisonnable ?. Michel Magny; Hervé Richard. Histoire du climat dans les Montagnes du Jura – Écosystèmes et sociétés face à un avenir incertain, Editions de La Belle Etoile, pp.218-224, 2023, 978-2-491372-31-6. ⟨hal-04310200⟩

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Valentine Python, François Gillet. Les services écosystémiques de la forêt jurassienne face au réchauffement climatique. Michel Magny; Hervé Richard. Histoire du climat dans les Montagnes du Jura – Écosystèmes et sociétés face à un avenir incertain, Editions de La Belle Etoile, pp.209-212, 2023, 978-2-491372-31-6. ⟨hal-04310251⟩

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Ouvrages

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Daniel Borcard, François Gillet, Pierre Legendre. Numerical Ecology with R, Japanese edition. Kyoritsu Shuppan Co. Ltd, 496 p., 2023. ⟨hal-04310142⟩

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2022

Article dans une revue

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Jonathan Lesven, Milva Druguet Dayras, Romain Borne, Cécile C Remy, François Gillet, et al.. Testing a new automated macrocharcoal detection method applied to a transect of lacustrine sediment cores in eastern Canada. Quaternary Science Reviews, 2022, 295, ⟨10.1016/j.quascirev.2022.107780⟩. ⟨hal-03808471⟩

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Riccardo Guarino, Marina Guccione, François Gillet. Plant communities, synusiae and the arithmetic of a sustainable classification. Vegetation Classification and Survey, 2022, 3, pp.7-13. ⟨10.3897/VCS.60951⟩. ⟨hal-03573758⟩

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Communication dans un congrès

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Florence Mazier, Yael Schwertz, Stéphane Binet, Cédric Gaucherel, Didier Galop, et al.. Dynamics of ecosystem services and plant diversity over the past 200 years. Ohmpyr2022 : Séminaire de restitution des projets 2019-2021 de l'OHM Pyrénées Haut Vicdessos 2022, CNRS UMR 5602 GEODE, Sep 2022, Toulouse, France. ⟨10.34972/driihm-5c54de⟩. ⟨hal-03822072⟩

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Florence Mazier, Yael Schwertz, Stéphane Binet, Cédric Gaucherel, Didier Galop, et al.. Dynamics of ecosystem services and plant diversity over the past 200 years. International Symposium of LabEx DRIIHM 2022, LabEx DRIIHM OHMi Nunavik CNRS-InEE, Jun 2022, Nantes, France. ⟨10.34972/driihm-5c54de⟩. ⟨hal-03789512⟩

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2021

Article dans une revue

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Iwona Dembicz, Jürgen Dengler, François Gillet, Thomas Matthews, Manuel Steinbauer, et al.. Fine-grain beta diversity in Palaearctic open vegetation: variability within and between biomes and vegetation types. Vegetation Classification and Survey, 2021, 2, pp.293-304. ⟨10.3897/VCS/2021/77193⟩. ⟨hal-03533836⟩

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Idoia Biurrun, Remigiusz Pielech, Iwona Dembicz, François Gillet, Łukasz Kozub, et al.. Benchmarking plant diversity of Palaearctic grasslands and other open habitats. Journal of Vegetation Science, 2021, 32 (4), ⟨10.1111/JVS.13050⟩. ⟨hal-03345369⟩

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Benoit Richard, Jean‐luc Dupouey, Emmanuel Corcket, Didier Alard, Frédéric Archaux, et al.. The climatic debt is growing in the understorey of temperate forests: Stand characteristics matter. Global Ecology and Biogeography, 2021, 30 (7), pp.1474-1487. ⟨10.1111/geb.13312⟩. ⟨hal-03293479⟩

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Iwona Dembicz, Jürgen Dengler, Manuel Steinbauer, Thomas Matthews, Sándor Bartha, et al.. Fine‐grain beta diversity of Palaearctic grassland vegetation. Journal of Vegetation Science, 2021, 32 (3), ⟨10.1111/jvs.13045⟩. ⟨hal-03286015⟩

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Jinghui Zhang, François Gillet, Sándor Bartha, Juha Mikael Alatalo, Idoia Biurrun, et al.. Scale dependence of species–area relationships is widespread but generally weak in Palaearctic grasslands. Journal of Vegetation Science, 2021, 32 (3), pp.e13044. ⟨10.1111/jvs.13044⟩. ⟨hal-03286001⟩

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Corentin Nicod, François Gillet. Recent changes in mountain hay meadows of high conservation value in eastern France. Applied Vegetation Science, 2021, 24 (2), ⟨10.1111/avsc.12573⟩. ⟨hal-03202361⟩

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Thibault Moulin, Antoine Perasso, Pierluigi Calanca, François Gillet. DynaGraM: A process-based model to simulate multi-species plant community dynamics in managed grasslands. Ecological Modelling, 2021, 439, pp.109345. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2020.109345⟩. ⟨hal-03092517⟩

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Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré, B. Karimi, Sophie Sadet-Bourgeteau, C. Djemiel, M. Brie, et al.. Microbial transfers from permanent grassland ecosystems to milk in dairy farms in the Comté cheese area. Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.18144. ⟨10.1038/s41598-021-97373-6⟩. ⟨hal-03345380⟩

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Melody Lim, Frédéric Blanc, Johan Michaux, Lise-Marie Pigneur, François Gillet, et al.. Étude comparative de la densité et du déplacement des Desmans des Pyrénées Galemys pyrenaicus (É. Geoffroy Saint-Hilaire, 1811) par une méthode non invasive. Naturae, 2021, 17, pp.233-242. ⟨10.5852/naturae2021a17⟩. ⟨hal-03347447⟩

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2020

Article dans une revue

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Corentin Nicod, Geoffroy Couval, Patrick Giraudoux, François Gillet. Vole disturbances and plant community diversity in a productive hay meadow. Acta Oecologica, 2020, 106, pp.103585. ⟨10.1016/j.actao.2020.103585⟩. ⟨hal-03148208⟩

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Communication dans un congrès

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Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré, Sophie Sadet-Bourgeteau, Brie, Margot, Dumont, Julie, Campedelli, Mathilde, et al.. Évaluation des transferts microbiens du sol au lait en filière AOP Comté. Congrès international francophone 3R 2020, une 25ème édition numérique au plus près des grands enjeux des filières animales, Dec 2020, paris, France. ⟨hal-03103282⟩

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Ouvrages

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Daniel Borcard, François Gillet, Pierre Legendre. Numerical Ecology with R, Second Chinese Edition. Higher Education Press, 2020. ⟨hal-03092614⟩

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2019

Article dans une revue

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Corentin Nicod, Bérangère Leys, Yorick Ferrez, Vincent Manneville, Arnaud Mouly, et al.. Towards the assessment of biodiversity and management practices in mountain pastures using diagnostic species?. Ecological Indicators, 2019, 107, pp.1-9. ⟨10.1016/j.ecolind.2019.105584⟩. ⟨hal-02270642⟩

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Vincent Bretagnolle, Marc Benoît, Mathieu Bonnefond, Vincent Breton, Jon Church, et al.. Action-orientated research and framework: insights from the French long-term social-ecological research network. Ecology and Society, 2019, 24 (3), pp.10. ⟨10.5751/ES-10989-240310⟩. ⟨hal-02413687⟩

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Charles Henriot, Daniel Martak, Quentin Cuenot, Christophe Loup, Hélène Masclaux, et al.. Occurrence and ecological determinants of the contamination of floodplain wetlands with Klebsiella pneumoniae and pathogenic or antibiotic-resistant Escherichia coli. FEMS Microbiology Ecology, 2019, 95 (8), ⟨10.1093/femsec/fiz097⟩. ⟨hal-02315686⟩

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José Zapata-Carbonell, Carole Bégeot, Nicolas Carry, Flavien Choulet, Pauline Delhautal, et al.. Spontaneous ecological recovery of vegetation in a red gypsum landfill: Betula pendula dominates after 10 years of inactivity. Ecological Engineering, 2019, ⟨10.1016/j.ecoleng.2019.03.013⟩. ⟨insu-02537945⟩

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Tommy Andriollo, François Gillet, Johan R. Michaux, Manuel Ruedi. The menu varies with metabarcoding practices: A case study with the bat Plecotus auritus. PLoS ONE, 2019, 14 (7), ⟨10.1371/journal.pone.0219135⟩. ⟨hal-02627771⟩

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Communication dans un congrès

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François Gillet, Thibault Moulin, Corentin Nicod. Disturbance modelling of plant community dynamics in managed grasslands. ISEM 2019, The International Society for Ecological Modelling Global Conference 2019, Oct 2019, Salzburg, Austria. ⟨hal-03533924⟩

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Thibault Moulin, Pierluigi Calanca, François Gillet. Modelling grassland biodiversity under climate change and implications for ecosystem services. 2nd International REKLIM Conference, Sep 2019, Berlin, Germany. ⟨hal-03534008⟩

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2018

Article dans une revue

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Jurgen Dengler, Viktoria Wagner, François Gillet, Iwona Dembicz, Itziar García-Mijangos, et al.. GrassPlot – a database of multi-scale plant diversity in Palaearctic grasslands. Phytocoenologia, 2018, 48 (3), pp.331-347. ⟨hal-01962684⟩

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Borja Jiménez-Alfaro, Susana Suárez-Seoane, Milan Chytrý, Stephan Hennekens, Wolfgang Willner, et al.. Modelling the distribution and compositional variation of plant communities at the continental scale. Diversity and Distributions, 2018, 24 (7), pp.978-990. ⟨10.1111/ddi.12736⟩. ⟨hal-02357324⟩

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Mohamed Bourioug, Olivier Girardclos, François Gillet, Laurence Alaoui-Sehmer, Pascale Bourgeade, et al.. Sewage sludge as a soil amendment in a Larix decidua plantation: Effects on tree growth and floristic diversity. Science of the Total Environment, 2018, 621, pp.291 - 301. ⟨10.1016/j.scitotenv.2017.11.283⟩. ⟨hal-01779745⟩

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Thibault Moulin, Antoine Perasso, François Gillet. Modelling vegetation dynamics in managed grasslands: Responses to drivers depend on species richness. Ecological Modelling, 2018, 374, pp.22 - 36. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2018.02.013⟩. ⟨hal-01779748⟩

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François Gillet, Philippe Julve. The integrated synusial approach to vegetation classification and analysis. Phytocoenologia, 2018, 48 (2), pp.141-152. ⟨10.1127/phyto/2017/0164⟩. ⟨hal-01779749⟩

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Communication dans un congrès

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José Zapata Carbonell, Carole Bégeot, Nicolas Carry, Flavien Choulet, François Gillet, et al.. Natural revegetation of a red gypsum dump. 15th International Phytotechnology Conference (IPC), Oct 2018, Novi-sad, Serbia. ⟨hal-03528797⟩

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Corentin Nicod, Bérangère Leys, Brendan Greffier, Christophe Hennequin, Yorick Ferrez, et al.. Assessing biodiversity and management impacts in mountain pastures using diagnostic species. International Association for Vegetation Science 61st Annual Symposium, Jul 2018, Bozeman, Montana, United States. ⟨hal-03533991⟩

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Thibault Moulin, Antoine Perasso, François Gillet. Sensitivity analysis of a grassland vegetation model: responses to drivers depend on species richness. MB2 2018, Mathematical Biology Modelling days of Besançon, Jun 2018, Besançon, France. ⟨hal-03534053⟩

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Ouvrages

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Daniel Borcard, François Gillet, Pierre Legendre. Numerical Ecology with R. Second Edition. Springer, pp.440, 2018, Use R! series, 978-3-319-71403-5. ⟨10.1007/978-3-319-71404-2⟩. ⟨hal-01779757⟩

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2017

Article dans une revue

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Alexander Peringer, Alexandre Buttler, François Gillet, Ileana Stupariu, Kiowa A. Schulze, et al.. Disturbance-grazer-vegetation interactions maintain habitat diversity in mountain pasture-woodlands. Ecological Modelling, 2017, 359, pp.301 - 310. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2017.06.012⟩. ⟨hal-01665868⟩

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Daniel Joly, François Gillet. Interpolation of temperatures under forest cover on a regional scale in the French Jura Mountains. International Journal of Climatology, 2017, 37 (S1), pp.659-670. ⟨10.1002/joc.5029⟩. ⟨hal-01494295⟩

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Bertrand Fournier, Arnaud Mouly, Marco Moretti, François Gillet. Contrasting processes drive alpha and beta taxonomic, functional and phylogenetic diversity of orthopteran communities in grasslands. Agriculture, Ecosystems & Environment, 2017, 242, pp.43 - 52. ⟨10.1016/j.agee.2017.03.021⟩. ⟨hal-01516588⟩

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Chapitre d'ouvrage

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Victor Frossard, Bruno Saussereau, Antoine Perasso, François Gillet. What is the robustness of early warning signals to temporal aggregation?. Using Paleolimnology for Management and Restoration of Lakes, Frontiers Media SA, 2017, Frontiers Research Topics, ⟨10.3389/978-2-88945-091-6⟩. ⟨hal-03533904⟩

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2016

Article dans une revue

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Bertrand Fournier, Arnaud A Mouly, François Gillet. Multiple assembly rules drive the co-occurrence of orthopteran and plant species in grasslands: Combining network, functional and phylogenetic approaches. Frontiers in Plant Science, 2016, 7, pp.1224. ⟨10.3389/fpls.2016.01224⟩. ⟨hal-01429221⟩

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Alexander Peringer, François Gillet, Gert Rosenthal, Ioana Stoicescu, Ileana Pătru-Stupariu, et al.. Landscape-scale simulation experiments test Romanian and Swiss management guidelines for mountain pasture-woodland habitat diversity. Ecological Modelling, 2016, 330, pp.41-49. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2016.03.013⟩. ⟨hal-01301774⟩

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François Gillet, Leslie Mauchamp, Pierre‐marie Badot, Arnaud Mouly. Recent changes in mountain grasslands: a vegetation resampling study. Ecology and Evolution, 2016, 6 (8), pp.2333-2345. ⟨10.1002/ece3.1987⟩. ⟨hal-04522942⟩

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François Gillet, Leslie Mauchamp, Pierre-Marie Badot, Arnaud Mouly. Recent changes in mountain grasslands: a vegetation resampling study. Ecology and Evolution, 2016, 6 (8), pp.2333-2345. ⟨10.1002/ece3.1987⟩. ⟨hal-01287302⟩

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Alexander Peringer, Kiowa A. Schulze, Ileana Stupariu, Mihai-Sorin Stupariu, Gert Rosenthal, et al.. Multi-scale feedbacks between tree regeneration traits and herbivore behavior explain the structure of pasture-woodland mosaics. Landscape Ecology, 2016, 31 (4), pp.913-927. ⟨10.1007/s10980-015-0308-z⟩. ⟨hal-01259876⟩

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Leslie Mauchamp, Arnaud Mouly, Pierre-Marie Badot, François Gillet. Impact of nitrogen inputs on multiple facets of plant biodiversity in mountain grasslands: does nutrient source matter?. Applied Vegetation Science, 2016, 19 (2), pp.206-217. ⟨10.1111/avsc.12214⟩. ⟨hal-01259898⟩

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François Gillet, Maria Teresa Cabria Garrido, Frédéric Blanc, Christine Fournier-Chambrillon, Mélanie Nemoz, et al.. Evidence of fine-scale genetic structure for the endangered Pyrenean desman (Galemys pyrenaicus) in the French Pyrenees. Journal of Mammalogy, 2016, 98 (2), pp.523-532. ⟨10.1093/jmammal/gyx002⟩. ⟨hal-01518570⟩

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François Gillet, Bruno Le Roux, Frederic Blanc, Aurélie Bodo, Christine Fournier-Chambrillon, et al.. Genetic monitoring of the endangered Pyrenean desman (Galemys pyrenaicus) in the Aude River, France. Belgian Journal of Zoology, 2016, 146 (1), pp.44-52. ⟨hal-02632227⟩

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Communication dans un congrès

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François Gillet, Leslie Mauchamp, Pierre-Marie Badot, Arnaud Mouly. Biodiversité des prairies mésophiles en Franche-Comté : tendances récentes et défis pour l’avenir. Colloque « Du Reculet aux sommets alpins : quels changements sur les crêtes ? », Feb 2016, Gex, France. ⟨hal-03533936⟩

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Jürgen Dengler, Elisabeth Hüllbusch, Claudia Bita-Nicolae, Milan Chytrý, Yakiv P. Didukh, et al.. Ecological Indicator Values of Europe (EIVE) 1.0: a powerful open-access tool for vegetation scientists. European Vegetation Survey 2016, Jan 2016, Rome, Italy. ⟨10.13140/RG.2.2.36391.34728⟩. ⟨hal-01429226⟩

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Poster de conférence

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Thibault Moulin, Antoine Perasso, François Gillet. DynaGraM, Dynamic Grassland Model - Predicting changes in plant community composition and ecosystem function. MPDE 2016, Models in Population Dynamics and Ecology, Sep 2016, Marseille, France. ⟨hal-03534122⟩

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2015

Article dans une revue

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Bertrand Fournier, François Gillet, Renée-Claire Le Bayon, Edward A. D. Mitchell, Marco Moretti. Functional responses of multitaxa communities to disturbance and stress gradients in a restored floodplain. Journal of Applied Ecology, 2015, 52 (5), pp.1364-1373. ⟨10.1111/1365-2664.12493⟩. ⟨hal-01211251⟩

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Miquel de Cáceres, Milan Chytrý, Emiliano Agrillo, Fabio Attorre, Zoltán Botta-Dukát, et al.. A comparative framework for broad-scale plot-based vegetation classification. Applied Vegetation Science, 2015, 18 (4), pp.543-560. ⟨10.1111/avsc.12179⟩. ⟨hal-01211250⟩

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Gabriel Reboux, Steffi Rocchi, Victor Frossard, Emeline Scherer, Benoit Valot, et al.. Caractérisation microbiologique de 3193 logements français des enfants de la cohorte ELFE. Journal of Medical Mycology = Journal de Mycologie Médicale, 2015, 25 (3), pp.228. ⟨10.1016/j.mycmed.2015.06.027⟩. ⟨hal-01211279⟩

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Victor Frossard, Bruno Saussereau, Antoine Perasso, François Gillet. What is the robustness of early warning signals to temporal aggregation?. Frontiers in Ecology and Evolution, 2015, 3, pp.112. ⟨10.3389/fevo.2015.00112⟩. ⟨hal-01211252⟩

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Simon Belle, Laurent Millet, François Gillet, Valérie Verneaux, Michel Magny. Assemblages and paleo-diet variability of subfossil Chironomidae (Diptera) from a deep lake (Lake Grand Maclu, France). Hydrobiologia, 2015, 755 (1), pp.145-160. ⟨10.1007/s10750-015-2222-4⟩. ⟨hal-01117797⟩

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Anaïs Charbonnel, Laetitia Buisson, Marjorie Biffi, Frank d'Amico, Aurélien Besnard, et al.. Integrating hydrological features and genetically validated occurrence data in occupancy modeling of an endemic and endangered semi-aquatic mammal species, Galemys pyrenaicus, in a Pyrenean catchment. Biological Conservation, 2015, 184, pp.182-192. ⟨10.1016/j.biocon.2015.01.019⟩. ⟨hal-01494960⟩

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S. Rocchi, Gabriel Reboux, V. Frossard, E. Scherer, Benoit Valot, et al.. Microbiological characterization of 3193 French dwellings of Elfe cohort children. Science of the Total Environment, 2015, 505, pp.1026-1035. ⟨10.1016/j.scitotenv.2014.10.086⟩. ⟨hal-01117795⟩

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Raul Quezada-Hinojosa, Karl B. Föllmi, François Gillet, Virginie Matera. Cadmium accumulation in six common plant species associated with soils containing high geogenic cadmium concentrations at Le Gurnigel, Swiss Jura Mountains. CATENA, 2015, 124, pp.85-96. ⟨10.1016/j.catena.2014.09.007⟩. ⟨hal-01074594⟩

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François Gillet, Maria Teresa Cabria, Mélanie Némoz, Frederic Blanc, Christine Fournier-Chambrillon, et al.. PCR-RFLP identification of the endangered Pyrenean desman, Galemys pyrenaicus (Soricomorpha, Talpidae), based on faecal DNA. Mammalia, 2015, 79 (4), pp.473-477. ⟨10.1515/mammalia-2014-0093⟩. ⟨hal-02634511⟩

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Communication dans un congrès

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François Gillet, Leslie Mauchamp, Arnaud Mouly, P. M. Badot. Recent vegetation changes in montane grasslands: a diachronic resampling study. Understanding broad-scale vegetation patterns., International Association for Vegetation Science, Jul 2015, Brno, Czech Republic. pp.135. ⟨hal-01211280⟩

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Poster de conférence

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François Gillet. Phytobase: a tool for the integrated synusial approach of vegetation classification at regional to national scale. Chytry M; Zeleny D; Hettenbergerova E. Understanding broad-scale vegetation patterns, Jul 2015, Brno, Czech Republic. 58th Symposium of the International Association for Vegetation Science (IAVS) – Understanding broad-scale vegetation patterns, Brno, République Tchèque, pp.136, 2015. ⟨hal-01211283⟩

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2014

Article dans une revue

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Leslie Mauchamp, Arnaud Mouly, Pierre-Marie Badot, François Gillet. Impact of management type and intensity on multiple facets of grassland biodiversity in the French Jura Mountains. Applied Vegetation Science, 2014, 17 (4), pp.645-657. ⟨10.1111/avsc.12116⟩. ⟨hal-01074591⟩

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Rémi Perronne, Leslie Mauchamp, Arnaud Mouly, François Gillet. Contrasted taxonomic, phylogenetic and functional diversity patterns in semi-natural permanent grasslands along an altitudinal gradient. Plant Ecology and Evolution, 2014, 147 (2), pp.165 - 175. ⟨10.5091/plecevo.2014.885⟩. ⟨hal-01074588⟩

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Borja Jiménez-Alfaro, Michal Hájek, Rasmus Ejrnaes, John Rodwell, Paweł Pawlikowski, et al.. Biogeographic patterns of base-rich fen vegetation across Europe. Applied Vegetation Science, 2014, 17 (2), pp.367-380. ⟨10.1111/avsc.12065⟩. ⟨hal-00927299⟩

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Yorick Ferrez, Max André, François Gillet, Philippe Juillerat, Marc Philippe, et al.. Inventaire de la flore vasculaire (Ptéridophytes et Spermaphytes) de Franche-Comté : Indigénats, raretés, menaces, protections. Les Nouvelles Archives de la Flore jurassienne et du nord-est de la France, 2014, 11, pp.5-49. ⟨hal-01117800⟩

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Communication dans un congrès

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Rémi Perronne, Leslie Mauchamp, Arnaud Mouly, François Gillet. Diversité taxonomique, phylogénétique et fonctionnelle de trois syntaxons des prairies permanentes. 10. congrès francophone d’écologie des communautés végétales ECOVEG 10 : Ecologie des Communautés Végétales, Apr 2014, Lyon, France. ⟨hal-02799354⟩

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François Gillet. Commentaires préliminaires à une synthèse. Nouveaux défis de la modélisation : l’agro‐écologie, INRA, Feb 2014, Paris, France. pp.36-37. ⟨hal-01117802⟩

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Chapitre d'ouvrage

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Alexander Peringer, Kiowa Alraune Schulze, Ileana Stupariu, Mihai-Sorin Stupariu, Alexandre Buttler, et al.. Klimawandel-angepasstes, post-konservatives Management halb-offener Weidelandschaften. Feit U.; Korn H. Treffpunkt Biologische Vielfalt, 14, 2014, BfN-Tagung. ⟨hal-01117799⟩

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Ouvrages

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Daniel Borcard, François Gillet, Pierre Legendre. Numerical Ecology with R (Chinese Edition). Higher Education Press, 275 p., 2014, 978-7040394726. ⟨hal-01117803⟩

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Pré-publication, Document de travail

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François Gillet. Guide d'utilisation de Phytobase (version 8.3), base de données phytosociologiques. 2014. ⟨hal-01306418⟩

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2013

Article dans une revue

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Joël Chételat, Michael Kalbermatten, Kathryn S.M. Lannas, Thomas Spiegelberger, Jean-Bruno Wettstein, et al.. A Contextual Analysis of Land-Use and Vegetation Changes in Two Wooded Pastures in the Swiss Jura Mountains. Ecology and Society, 2013, 18 (1), pp.39. ⟨10.5751/ES-05287-180139⟩. ⟨hal-00768736⟩

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Robert Huber, Simon Briner, Alexander Peringer, Stefan Lauber, Roman Seidl, et al.. Modeling Social-Ecological Feedback Effects in the Implementation of Payments for Environmental Services in Pasture-Woodlands. Ecology and Society, 2013, 18 (2), pp.41. ⟨10.5751/ES-05487-180241⟩. ⟨hal-01074586⟩

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Konstantin S. Gavazov, Alexander Peringer, Alexandre Buttler, François Gillet, Thomas Spiegelberger. Dynamics of Forage Production in Pasture-woodlands of the Swiss Jura Mountains under Projected Climate Change Scenarios. Ecology and Society, 2013, 18 (1), pp.38. ⟨10.5751/ES-04974-180138⟩. ⟨hal-00768738⟩

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Alexander Peringer, Silvana Siehoff, Joël Chételat, Thomas Spiegelberger, Alexandre Buttler, et al.. Past and future landscape dynamics in pasture-woodlands of the Swiss Jura Mountains under climate change. Ecology and Society, 2013, 18 (3), pp.11. ⟨10.5751/ES-05600-180311⟩. ⟨hal-00768743⟩

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Communication dans un congrès

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François Gillet, Leslie Mauchamp, Adeline Rouzet. Regional rarity versus local scarcity in plant communities: Impact of species removal on model performance in constrained ordination. 56th IAVS Symposium, 2013, Tartu, Estonia. pp.73. ⟨hal-00927303⟩

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Leslie Mauchamp, Arnaud Mouly, François Gillet. Contrasted reponses of taxonomic, phylogenetic and functional diversity to grassland management. 56th IAVS Symposium, 2013, Tartu, Estonia. pp.152. ⟨hal-00927301⟩

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Ouvrages

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Leslie Mauchamp, François Gillet, Arnaud Mouly, Pierre-Marie Badot. Les prairies : biodiversité et services écosystémiques. CNAOL-UFC. Presses universitaires de Franche-Comté, pp.134, 2013, Pratiques et Techniques, 978-2-84867-437-7. ⟨hal-00768735⟩

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2012

Article dans une revue

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Caroline Meyer, Daniel Gilbert, François Gillet, M. Moskura, M. Franchi, et al.. Using "bryophytes and their associated testate amoeba" microsystems as indicators of atmospheric pollution. Ecological Indicators, 2012, 13 (1), pp.144-151. ⟨10.1016/j.ecolind.2011.05.020⟩. ⟨hal-00654500⟩

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Benjamin Dietre, Emilie Gauthier, François Gillet. Modern pollen rain and fungal spore assemblages from pasture woodlands at Lake Saint-Point (France). Review of Palaeobotany and Palynology, 2012, 186, pp.69-89. ⟨10.1016/j.revpalbo.2012.07.002⟩. ⟨hal-00768722⟩

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Alexandre Buttler, Thomas Spiegelberger, Joël Chételat, Michael Kalbermatten, Kathryn Lannas, et al.. Evolution récente et future des paysages sylvo-pastoraux du Jura vaudois. Journal Forestier Suisse, 2012, 163 (12), pp.469-480. ⟨hal-00768728⟩

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François Gillet, Alexandre Buttler, Thomas Spiegelberger. New insights in plant community ecology. Plant Ecology and Evolution, 2012, 145 (1), pp.3. ⟨10.5091/plecevo.2012.726⟩. ⟨hal-00768675⟩

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Thomas Spiegelberger, François Gillet, Bernard Amiaud, Aurélie Thébault, Pierre Mariotte, et al.. How do plant community ecologists consider the complementarity of observational, experimental and theoretical approaches?. Plant Ecology and Evolution, 2012, 145 (1), pp.4-12. ⟨10.5091/plecevo.2012.699⟩. ⟨hal-00768673⟩

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Mouldi Gamoun, A. Ouled Belgacem, B. Hanchi, M. Neffati, François Gillet. Effet du pâturage sur la diversité floristique des parcours arides du sud tunisien. Revue d'Écologie, 2012, 67 (3), pp.271-282. ⟨hal-00768678⟩

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Mouldi Gamoun, Azaiez Ouled Belgacem, Belgacem Hanchi, Mohamed Neffati, François Gillet. Effet du pâturage sur la diversité floristique des parcours arides du sud tunisien. Revue d'Écologie, 2012, 67 (3), pp.271-282. ⟨hal-03533295⟩

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Alexandre Buttler, Konstantin Gavazov, Alexander Peringer, Silvana Siehoff, Pierre Mariotte, et al.. Conservation des pâturages boisés du Jura : défis climatiques et agro-politiques. Agrarforschung Schweiz - Recherche Agronomique Suisse, 2012, 3 (7-8), pp.346-353. ⟨hal-00768676⟩

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Communication dans un congrès

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Bart Muys, J. Hynynen, M. Palahí, M.J. Lexer, M. Fabrika, et al.. Simulation tools for decision support to adaptive forest management in Europe. COST FP0603 Final Meeting, Mar 2012, Pierroton, France. ⟨hal-00814281⟩

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Rupert Seidl, P.M. Fernandes, T.F. Fonseca, François Gillet, A.M. Jönsson, et al.. Concepts and challenges in modelling natural disturbances in forest ecosystems. COST FP0603 Final Meeting, Mar 2012, Pierroton, France. ⟨hal-00814277⟩

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François Gillet, Alexander Peringer. Dynamic modelling of silvopastoral landscape structure: Past reconstruction and scenarios for future climate and land use. COST FP0603 Final Meeting, Mar 2012, Pierroton, France. ⟨hal-00814269⟩

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François Gillet, Alexander Peringer. Dynamic modelling of silvopastoral landscape structure: Scenarios for future climate and land use. Managing Resources of a Limited Planet: Pathways and Visions under Uncertainty, 2012, Leipzig, Germany. pp.860-867. ⟨hal-00814266⟩

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2011

Article dans une revue

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Ling-Ping Zhao, Ji-Suai Su, Gao-Lin Wu, François Gillet. Long-term effects of grazing exclusion on aboveground and belowground plant species diversity in a steppe of the Loess Plateau, China. Plant Ecology and Evolution, 2011, 144 (3), pp.313-320. ⟨10.5091/plecevo.2011.617⟩. ⟨hal-00654507⟩

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Florian Kohler, Charlotte Vandenberghe, Ralph Imstepf, François Gillet. Restoration of threatened arable weed communities in abandoned mountainous crop fields. Restoration Ecology, 2011, 19 (101), pp.62-69. ⟨10.1111/j.1526-100X.2009.00641.x⟩. ⟨hal-00442516⟩

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Floriane Bosch-Cano, Nadine Bernard, Bertrand Sudre, François Gillet, Michel Thibaudon, et al.. Human exposure to allergenic pollens: A comparison between urban and rural areas.. Environmental Research, 2011, 111 (5), pp.619-625. ⟨10.1016/j.envres.2011.04.001⟩. ⟨hal-00601406⟩

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Rupert Seidl, Paulo M. Fernandes, Teresa F. Fonseca, François Gillet, Anna Maria Jönsson, et al.. Modelling natural disturbances in forest ecosystems: A review. Ecological Modelling, 2011, 222 (4), pp.903-924. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2010.09.040⟩. ⟨hal-00530194⟩

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Aurélie Thébault, François Gillet, Heinz Müller-Schärer, Alexandre Buttler. Polyploidy and invasion success: trait trade-offs in native and introduced cytotypes of two Asteraceae species. Plant Ecology, 2011, 212 (2), pp.315-325. ⟨10.1007/s11258-010-9824-8⟩. ⟨hal-00582671⟩

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Ouvrages

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Daniel Borcard, François Gillet, Pierre Legendre. Numerical Ecology with R. Springer, pp.302, 2011, Use R!, 978-1-4419-7975-9. ⟨hal-00530195⟩

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Yorick Ferrez, Gilles Bailly, Thérèse Beaufils, Rémi Collaud, Michel Caillet, et al.. Synopsis des groupements végétaux de Franche-Comté. Société botanique de Franche-Comté, Conservatoire botanique national de Franche-Comté, pp.282, 2011, Les Nouvelles Archives de la Flore jurassienne et du nord-est de la France, 1765-0674. ⟨hal-00683776⟩

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2010

Article dans une revue

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B. Muys, J. Hynynen, M. Palahí, M.J. Lexer, M. Fabrika, et al.. Simulation tools for decision support to adaptive forest management in Europe. Forest Systems, 2010, 19 (SI), pp.86-99. ⟨hal-00558604⟩

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François Gillet, Martina Peter, François Ayer, Rita Bütler, Simon Egli. Long-term dynamics of aboveground fungal communities in a subalpine Norway spruce forest under elevated nitrogen input. Oecologia, 2010, 164 (2), pp.499-510. ⟨10.1007/s00442-010-1668-3⟩. ⟨hal-00479642⟩

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François Gillet, Florian Kohler, Charlotte Vandenberghe, Alexandre Buttler. Effect of dung deposition on small-scale patch structure and seasonal vegetation dynamics in mountain pastures. Agriculture, Ecosystems & Environment, 2010, 135, pp.34-41. ⟨10.1016/j.agee.2009.08.006⟩. ⟨hal-00434296⟩

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Matthew L. Carlson, Lindsey A. Flagstad, François Gillet, Edward A. D. Mitchell. Community development along a proglacial chronosequence: are above-ground and below-ground community structure controlled more by biotic than abiotic factors?. Journal of Ecology, 2010, 98 (5), pp.1084-1095. ⟨10.1111/j.1365-2745.2010.01699.x⟩. ⟨hal-00501619⟩

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Pré-publication, Document de travail

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François Gillet. Guide d'utilisation de Phytobase 8, base de données phytosociologiques. 2010. ⟨hal-00558605⟩

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2009

Article dans une revue

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Pierre Rossi, François Gillet, Emmanuelle Rohrbach, Nouhou Diaby, Christof Holliger. Statistical assessment of variability of terminal restriction fragment length polymorphism analysis applied to complex microbial communities.. Applied and Environmental Microbiology, 2009, 75 (22), pp.7268-70. ⟨10.1128/AEM.00135-09⟩. ⟨hal-00434294⟩

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Chapitre d'ouvrage

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Alexandre Buttler, Florian Kohler, François Gillet. The Swiss mountain wooded pastures: patterns and processes. Rigueiro-Rodriguez A., McAdam J. & Mosquera-Losada M.R. Agroforestry in Europe: Current Status and Future Prospects, Springer, pp.377-396, 2009, Advances in Agroforestry. ⟨hal-00357749⟩

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2008

Article dans une revue

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François Gillet. Modelling vegetation dynamics in heterogeneous pasture-woodland landscapes. Ecological Modelling, 2008, 217 (1-2), pp.1-18. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2008.05.013⟩. ⟨hal-00357747⟩

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Nicolas Küffer, François Gillet, Béatrice Senn-Irlet, Daniel Job, Michel Aragno. Ecological determinants of fungal diversity on dead wood in European forests. Fungal Diversity, 2008, 30, pp.83-95. ⟨hal-00357745⟩

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Marco Moretti, Chantal Staehli, François Gillet. Determinants for the conservation of a vulnerable fire-dependent species at its marginal range. Plant Ecology, 2008, 199 (1), pp.89-98. ⟨10.1007/s11258-008-9414-1⟩. ⟨hal-00357746⟩

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Chapitre d'ouvrage

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François Gillet. Ecological Models: Plant Competition. Jørgensen S.E. & Fath B.D. Encyclopedia of Ecology, 1st Edition, Vol. 4, Elsevier, pp.2783-2793, 2008. ⟨hal-00357748⟩

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2007

Article dans une revue

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Cédric Ratzé, François Gillet, Jean-Pierre Müller, Kilian Stoffel. Simulation modelling of ecological hierarchies in constructive dynamical systems. Ecological Complexity, 2007, 4 (1-2), pp.13-25. ⟨hal-00346759⟩

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François Freléchoux, François Gillet, Marco Meisser. Succession secondaire et perte de diversité végétale après réduction du broutage dans un pâturage boisé des Alpes centrales suisses. Botanica Helvetica, 2007, 117, pp.37-56. ⟨hal-00357743⟩

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2006

Article dans une revue

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Florian Kohler, François Gillet, Stéphanie Reust, Helene H. Wagner, Fahzia Gadallah, et al.. Spatial and seasonal patterns of cattle habitat use in a mountain wooded pasture. Landscape Ecology, 2006, 21 (2), pp.281-295. ⟨10.1007/s10980-005-0144-7⟩. ⟨hal-00442544⟩

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Florian Kohler, François Gillet, Jean-Michel Gobat, Alexandre Buttler. Effect of cattle activities on gap colonisation in mountain pastures. Folia Geobotanica, 2006, 41 (3), pp.289-304. ⟨hal-00442532⟩

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Marylin Jossi, Nathalie Fromin, Sonia Tarnawski, Florian Kohler, François Gillet, et al.. How elevated pCO2 modifies total and metabolically active bacterial communities in the rhizosphere of two perennial grasses grown under field conditions. FEMS Microbiology Ecology, 2006, 55 (3), pp.339-350. ⟨10.1111/j.1574-6941.2005.00040.x⟩. ⟨hal-00442595⟩

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2003

Article dans une revue

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François Freléchoux, Alexandre Buttler, François Gillet, Jean-Michel Gobat, Fritz Schweingruber. Succession from bog pine (Pinus uncinata var. rotundata) to Norway spruce (Picea abies) stands in relation to anthropic factors in Les Saignolis bog, Jura Mountains, Switzerland. Annals of Forest Science, 2003, 60 (4), pp.347-356. ⟨10.1051/forest:2003025⟩. ⟨hal-00883705⟩

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