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Metabolites secondaires d'invertebres marins et biosynthese in vivo d'alcaloides d'Agelas oroides Nadja Cachet Le groupe Substances Naturelles Marines du LCMBA (UMR 6001 CNRS-UNSA) se consacre à l'isolement et à la caractérisation de nouvelles molécules bioactives à partir d'invertébrés marins (spongiaires et cnidaires principalement). Suivant l'intérêt que ces molécules originales suscitent, leur valorisation peut concerner autant le domaine de la pharmaceutique que celui de la biosynthèse ou de l'écologie chimique. Ce manuscrit présente les travaux de recherche réalisés sur les deux éponges Pandaros acanthifolium et Agelas oroides, et sur les deux cnidaires Astroides calycularis et Parazoanthus axinellae. P. acanthifolium, très peu étudié, a permis l'isolement d'une nouvelle famille de saponines stéroïdiennes. La famille des orthidines et une nouvelle aplysinopsine, ont été isolées pour la première fois d'A. calycularis. Enfin, nous décrivons une nouvelle famille d'alcaloïdes isolée de P. axinellae qui nous a permis de distinguer deux morphotypes de P. axinellae d'après leurs profils chimiques. A. oroides a été choisi comme modèle d'étude pour la mise en place d'un nouveau protocole de biosynthèse in vivo des alcaloïdes de type pyrrole-2-aminoimidazoles (P2AI). Ces études permettent de confirmer l'utilisation de la proline dans la biosynthèse des P2AI.

Multi-polarization quantum control of rotational motion through dipole coupling Gabriel Turinici et al. In this work we analyze the quantum controllability of rotational motion under the influence of an external laser field coupled through a permanent dipole moment. The analysis takes into consideration up to three polarization fields, but we also discuss the consequences for working with fewer polarized fields.

Systèmes micro-nano-structurés et couches minces multifonctionnels, à base de dioxyde de ruthénium : élaborations et propriétés catalytiques et électriques Pawel Nowakowski Le présent travail porte sur l'étude de nanomatériaux et couches minces élaborés à base d'oxydes de ruthénium, à finalités catalytiques et électriques. Ces matériaux sont multifonctionnels et pourraient être destinés à des applications variées aussi bien dans le domaine de la microélectronique et des microcapteurs, que dans l'industrie chimique (catalyse, conversion du méthane). L'étude développe les relations entre élaborations, microstructures et propriétés catalytiques et électriques. Les nanopoudres de RuO2 élaborées par voie sol gel présentent des propriétés catalytiques intéressantes vis-à-vis de CH4 et CO. Des affinements structuraux (méthode Rietveld) ont montré une légère modification des mailles cristallines lorsque les tailles de cristallites étaient nanométriques (10 à 20 nm). La microscopie électronique en transmission a permis de préciser les résultats obtenus par diffraction de rayons X sur les tailles de cristallites. L'efficacité catalytique a été mesurée par spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier en fonction de la température et du temps d'exposition au flux gazeux (air-méthane ou air-monoxyde de carbone). Les conversions de CH4 et de CO en CO2 ont été observées au-dessus de 200°C pour CH4, et à partir de la température ambiante (25°C) pour CO. Un modèle semi-empirique permettant de simuler le taux de conversion a été proposé et a permis de reproduire des comportements très différents pour la conversion de CH4 ou CO en fonction du temps. Des études de couches minces à base de RuO2 et de composites RuO2-CeO2 ont été entreprises, soit par spin-coating, soit par pulvérisation cathodique. Les couches obtenues par spin-coating manifestent une certaine activité catalytique liée à leur porosité. Les couches obtenues par pulvérisation cathodique sont des couches mixtes RuO2-CeO2. Elles n'ont aucune activité catalytique notable. Elles ont un comportement électrique non linéaire fortement lié à la microstructure et à la composition. Un modèle en loi de puissance a été appliqué avec succès pour décrire l'évolution de la conductivité en fonction de la composition en RuO2. Ces couches pourraient être utilisées dans des dispositifs piézorésistifs. En parallèle à ces études, un dispositif préfigurant un multicapteur de gaz a été mis au point.

An adverbial approach for the formal specification of topological constraints involving regions with broad boundaries L. Bejaoui et al. Topological integrity constraints control the topological properties of spatial objects and the validity of their topological relationships in spatial databases. These constraints can be specified by using formal languages such as the spatial extension of the Object Constraint Language (OCL). Spatial OCL allows the expression of topological constraints involving crisp spatial objects. However, topological constraints involving spatial objects with vague shapes (e.g., regions with broad boundaries) are not supported by this language. Shape vagueness requires using appropriate topological operators (e.g., strongly Disjoint, fairly Meet) to specify valid relations between these objects; otherwise, the constraints cannot be respected. This paper addresses the problem of the lack of terminology to express topological constraints involving regions with broad boundaries. We propose an extension of Spatial OCL based on a geometric model for objects with vague shapes and an adverbial approach for topological relations between regions with broad boundaries. This extension of Spatial OCL is then tested on an agricultural database.

Réorganisations cérébrales fonctionnelles dans la dysarthrie parkinsonienne Serge Pinto Les trois principales dysfonctions cérébrales observées lors de mouvements réalisés avec le membre supérieur dans la maladie de Parkinson (MP) sont 1/ une hypoactivation de l'aire motrice supplémentaire (AMS) et du cortex dorsolatéral préfrontal (DLPFC), 2/ une hyperactivation du cortex moteur primaire (M1) correspondant à la somatotopie du membre supérieur et 3/ une hyperactivation du cervelet. Le dysfonctionnement du circuit moteur impliquant les noyaux gris centraux (NGC) semble compensé par l'activation accrue de la boucle cortex-cervelet-cortex. Lors de la production de parole dans la MP, sont observées 1/ une hyperactivation de la partie rostrale de l'AMS et du DLPFC, 2/ une hypoactivation du cortex M1 correspondant à la somatotopie orofaciale et 3/ une hypoactivation du cervelet. Ces résultats renforcent le fait que les deux circuits moteurs parallèles, impliquant respectivement les NGC et le cervelet, sont impliqués dans le contrôle moteur de la production de parole. Dans la MP, le dysfonctionnement du premier circuit semble altérer l'activation du deuxième. Une tâche expérimentale combinant les deux types de mouvements (du membre supérieur et de la parole) a révélé une absence d'activation des aires motrices (cortex M1, cervelet) associées à la production de parole : seul le profil lié au mouvement de la main a été observé; il y aurait perte, dans la MP, de l'additivité fonctionnelle des activations cérébrales.

Méthodologie pour l'analyse d'interactions en contextes pathologiques - Alzheimer et polyhandicap Isabelle Guaïtella Dans cet article, nous proposons une observation et une analyse des "patterns" constitués d'items gestuels et vocaux produits en situation d'interaction par des patients atteints de la maladie d'Alzheimer et par des polyhandicapés adultes en relation avec des thérapeutes ou des pairs. Les items, ainsi que les patterns de communication qu'ils constituent, sont analysés automatiquement. Nos résultats montrent que, au-delà de leurs difficultés notamment langagières, les patients que nous avons étudiés sont non seulement capables de jouer leur rôle dans l'interaction, mais aussi de mener l'interaction et d'avoir des initiatives comportementales. En dépit d'un contexte fragilisé, les patients (en particulier Alzheimer) montrent à la fois une grande capacité à intégrer des éléments nouveaux et à s'impliquer dans l'interaction.

Beyond Bidimensionality: Parameterized Subexponential Algorithms on Directed Graphs Frederic Dorn et al. We develop two different methods to achieve subexponential time parameterized algorithms for problems on sparse directed graphs. We exemplify our approaches with two well studied problems. For the first problem, {\sc $k$-Leaf Out-Branching}, which is to find an oriented spanning tree with at least $k$ leaves, we obtain an algorithm solving the problem in time $2^{O(\sqrt{k} \log k)} n+ n^{O(1)}$ on directed graphs whose underlying undirected graph excludes some fixed graph $H$ as a minor. For the special case when the input directed graph is planar, the running time can be improved to $2^{O(\sqrt{k})}n + n^{O(1)}$. The second example is a generalization of the {\sc Directed Hamiltonian Path} problem, namely {\sc $k$-Internal Out-Branching}, which is to find an oriented spanning tree with at least $k$ internal vertices. We obtain an algorithm solving the problem in time $2^{O(\sqrt{k} \log k)} + n^{O(1)}$ on directed graphs whose underlying undirected graph excludes some fixed apex graph $H$ as a minor. Finally, we observe that for any $\epsilon>0$, the {\sc $k$-Directed Path} problem is solvable in time $O((1+\epsilon)^k n^{f(\epsilon)})$, where $f$ is some function of $\ve$. Our methods are based on non-trivial combinations of obstruction theorems for undirected graphs, kernelization, problem specific combinatorial structures and a layering technique similar to the one employed by Baker to obtain PTAS for planar graphs.

The Traveling Salesman Problem Under Squared Euclidean Distances Mark De Berg et al. Let $P$ be a set of points in $\mathbb{R}^d$, and let $\alpha \ge 1$ be a real number. We define the distance between two points $p,q\in P$ as $|pq|^{\alpha}$, where $|pq|$ denotes the standard Euclidean distance between $p$ and $q$. We denote the traveling salesman problem under this distance function by TSP($d,\alpha$). We design a 5-approximation algorithm for TSP(2,2) and generalize this result to obtain an approximation factor of $3^{\alpha-1}+\sqrt{6}^{\alpha}/3$ for $d=2$ and all $\alpha\ge2$. We also study the variant Rev-TSP of the problem where the traveling salesman is allowed to revisit points. We present a polynomial-time approximation scheme for Rev-TSP$(2,\alpha)$ with $\alpha\ge2$, and we show that Rev-TSP$(d, \alpha)$ is APX-hard if $d\ge3$ and $\alpha>1$. The APX-hardness proof carries over to TSP$(d, \alpha)$ for the same parameter ranges.

Finding and counting vertex-colored subtrees Guillemot Sylvain et al. The problems studied in this article originate in the Graph Motif problem introduced by Lacroix et al. (TCBB 2006) in the context of biological networks. The problem is to decide if a vertex-colored graph has a connected subgraph whose colors equals a given multiset of colors M. Using an algebraic framework recently introduced in Koutis (ICALP 2008) and Koutis, Williams (ICALP 2009), we obtain new FPT algorithms for Graph Motif and variants, with improved running times. We also obtain results on the counting versions of this problem, showing that the counting problem is FPT if M is a set, but becomes #W[1]-hard if M is a multiset with two colors.

Le recyclage de métaux d'origine industrielle au Sénégal Mamadou Babacar Ndiaye Le travail de recherche présenté dans le cadre de cette thèse, réalisée en cotutelle entre l'École Supérieure Polytechnique de Dakar (ESP) et l'École Centrale de Lyon (ECL), intitulé « Le recyclage de métaux d'origine industrielle au Sénégal » traite du problème du recyclage industriel des aciers et de celui, artisanal, des alliages d'aluminium. La question est abordée depuis la collecte des déchets jusqu'aux produits issus de leur valorisation : armatures pour béton armé et ustensiles de cuisine. Nous nous intéressons plus particulièrement à la qualité de ces produits. Il s'agit plus précisément des propriétés mécaniques des armatures en acier, qui se rompent parfois lors de leur mise en œuvre par pliage, et de la qualité alimentaire des alliages d'aluminium utilisés dans la fabrication d'ustensiles de cuisine et élaborés à partir de déchets provenant souvent de rebuts du secteur automobile. A l'issue de notre travail expérimental, nous avons déterminé une origine possible des défaillances des armatures à béton et avons montré, par des tests en milieu alimentaire, que les alliages d'aluminium utilisés ne présentent pas de dangers pour les usagers. Cette étude s'inscrit dans une problématique environnementale à laquelle se trouvent confrontés de plus en plus de pays, compte tenu de l'accroissement de la consommation des ménages et de la raréfaction des ressources en matière première et en énergie. Dans ce contexte, nous avons ajouté une dimension humaine et sociétale à ce travail scientifique en le prolongeant par une action de formation auprès des jeunes populations. Cette action s'inscrit par ailleurs dans un projet plus large de la Direction de l'Enseignement Elémentaire du Sénégal, de rénovation de l'enseignement des sciences à l'école élémentaire. Un module pédagogique, destiné au cycle 3, a été créé autour de la thématique des déchets et de leur devenir, en tenant compte des spécificités de l'école sénégalaise et en relation avec la partie scientifique développée dans la thèse. Il s'appuie sur une méthode d'enseignement innovante, l'investigation raisonnée, grâce à laquelle l'élève se trouve placé en tant qu'acteur de sa propre formation. L'originalité de cette recherche est donc qu'elle intègre l'ensemble des préoccupations, allant du traitement du déchet à l'éducation des populations, tout en restant centrée sur une problématique scientifique. Elle est une première concrétisation de l'accompagnement de l'école élémentaire par la communauté scientifique au Sénégal.

On the relevance of the dam break problem in the context of nonlinear shallow water equations Denys Dutykh et al. The classical dam break problem has become the de facto standard in validating the Nonlinear Shallow Water Equations (NSWE) solvers. Moreover, the NSWE are widely used for flooding simulations. While applied mathematics community is essentially focused on developing new numerical schemes, we tried to examine the validity of the mathematical model under consideration. The main purpose of this study is to check the pertinence of the NSWE for flooding processes. From the mathematical point of view, the answer is not obvious since all derivation procedures assumes the total water depth positivity. We performed a comparison between the two-fluid Navier-Stokes simulations and the NSWE solved analytically and numerically. Several conclusions are drawn out and perspectives for future research are outlined.

Contribution au diagnostic de machines électromécaniques : Exploitation des signaux électriques et de la vitesse instantanée Ali Ibrahim Cette Thèse aborde le diagnostic des défauts mécaniques des machines électromécaniques par traitement des signaux électriques (courants et tensions) issus des telles machines et reçus sur un ensemble des capteurs, et essayer d'extraire et de séparer les différentes composantes, électriques ou mécaniques, qui existent. Nous procédons par une modélisation de la machine asynchrone et du défaut de roulement pour expliquer le phénomène physique mis en jeu lors de l'apparition de ce type des défauts. Les outils de traitement du signal dédiés à l'analyse cyclostationnaire peuvent apporter de nouvelles solutions. Nous associons ces outils à l'approche classique de soustraction de bruit qui consiste à retrouver dans un signal donné tout ce qui est dû à un autre signal (mécanique → électrique et électrique → mécanique). Pour valider les études faites sur les signaux électriques, nous traitons aussi les signaux vibratoires. Il est nécessaire de suivre l'influence du défaut tout au long de la chaîne cinématique et d'étudier les transferts des variables mécaniques vers les variables électriques au sein de la machine électrique. La modélisation montre que ce transfert passe à travers la vitesse instantanée, il est donc important de vérifier la présence d'information relative au défaut sur celle-ci. Les défauts de roulement sont ciblés et nous proposons quelques moyens permettant l'utilisation de la vitesse instantanée comme indicateur de défaillances.

On the relevance of the dam break problem in the context of nonlinear shallow water equations Denys Dutykh et al. The classical dam break problem has become the de facto standard in validating the Nonlinear Shallow Water Equations (NSWE) solvers. Moreover, the NSWE are widely used for flooding simulations. While applied mathematics community is essentially focused on developing new numerical schemes, we tried to examine the validity of the mathematical model under consideration. The main purpose of this study is to check the pertinence of the NSWE for flooding processes. From the mathematical point of view, the answer is not obvious since all derivation procedures assumes the total water depth positivity. We performed a comparison between the two-fluid Navier-Stokes simulations and the NSWE solved analytically and numerically. Several conclusions are drawn out and perspectives for future research are outlined.

Adapting PILOTE model for water and yield management under direct seeding system: The case of corn and durum wheat in a Mediterranean context M.R. Khaledian et al. Crop models are useful tools for integrating knowledge of biophysical processes governing the plant-soil-atmosphere system. But few of them are easily usable for water and yield management especially under specific cropping systems such as direct seeding. Direct seeding into mulch (DSM) is an alternative for conventional tillage (CT). DSM modifies soil properties and creates a different microclimate from CT. So that, we should consequently consider these new conditions to develop or to adapt models. The aim of this study was to calibrate and validate the PILOTE [Mailhol, J.C., Olufayo, A.A., Ruelle, P., 1997. Sorghum and sunflower evapotranspiration and yield from simulated leaf area index. Agric. Water Manag. 35, 167-182; Mailhol, J.C., Zaïri A., Slatni A., Ben Nouma, B., El Amami, H., 2004. Analysis of irrigation systems and irrigation strategies for durum wheat in Tunisia. Agric. Water Manag. 70, 19-37], an operative crop model based on the leaf area index (LAI) simulation, for corn and durum wheat in both DSM and CT systems in Mediterranean climate. In DSM case, simple model modifications were proposed. This modified PILOTE version accounts for mulch and its impact on soil evaporation. In addition root progression was modified to account for lower soil temperatures in DSM for winter crops. PILOTE was calibrated and validated against field data collected from a 7-year trial at the experimental station of Lavalette (SE of France). Results indicated that PILOTE satisfactorily simulates LAI, soil water reserve (SWR), grain yield, and dry matter yield in both systems. The minimum coefficient of efficiency for SWR was 0.90. This new version of PILOTE can thus be used to manage water and yield under CT and DSM systems in Mediterranean climate.

Method validation for the analysis of estrogens (including conjugated compounds) in aqueous matrices C. Miege et al. Estrogens act as endocrine disruptors and are known to be discharged into the aquatic environment via effluents from wastewater- treatment plants (WWTPs). Efficient analytical protocols are needed to identify and to quantify estrogens in wastewaters and aquatic environments in order to study their sources, levels of exposure and modes of transfer. We developed and validated a new analytical method for estrogens in water. It quantifies five estrogenic hormones and their conjugated forms at the ng/L level in rivers, WWTP influents and effluents, with satisfactory precision (relative standard deviation of within-day analytical recoveries is usually <22%). The method is statistically specific, thanks to using perdeuterated hormones as internal surrogates, which proved to be an efficient means of correcting for matrix effects.

Investissement dans le capital humain et risque : Fondements théoriques et perspectives empiriques David Touahri Cette thèse étudie les effets du risque sur l'investissement dans le capital humain. Le chapitre 1 présente les contributions les plus significatives en économie de l'éducation qui placent l'étude de l'accumulation du capital humain dans un contexte d'incertitude. De notre analyse ressort l'importance de différencier les sources d'incertitude car elles peuvent avoir un effet contradictoire. C'est pourquoi, nous développons dans le chapitre 2 un modèle dynamique et stochastique dans lequel plusieurs sources d'incertitude sont prises en compte, concernant à la fois le processus d'accumulation du capital humain et le marché du travail. Nous montrons que l'effet global des différents risques est négatif, sauf pour ceux compensés par un excès de rendement. L'incapacité du modèle à faire apparaître l'éducation comme une protection face au risque, nous conduit dans le chapitre 3, à construire un modèle de décision dans lequel le système de formation produit à la fois des compétences productives (hypothèse de capital humain) mais aussi de l'information sur la véritable productivité des individus (hypothèse de signal). L'éducation apparaît alors comme une stratégie optimale de protection face aux risques, en particulier face au risque de chômage futur. Dans le chapitre 4, la discussion autour des principales contributions économétriques éclaire les difficultés à mesurer empiriquement le risque ; principalement différencier le risque de l'hétérogénéité non observée dans la variance observée des rendements éducatifs. Partant de notre modèle théorique, nous proposons alors les bases d'une stratégie d'estimation permettant d'identifier le sens de la relation éducation-risque.

Lettres d'aujourd'hui: lire les écrits vers le travail Séverine Equoy Hutin Cette contribution se propose d'observer le genre épistolaire tel qu'il se pratique aujourd'hui par les citoyens français dans le cadre d'une communication institutionnelle et d'examiner les modalités de l'appropriation des normes épistolaires (Adam, 1998, 2005), les potentialités signifiantes offertes par le genre dans la perspective de la constitution d'un positionnement en rapport à la norme requise et de la construction de l'identité du citoyen français au quotidien. Qu'il s'agisse de lettres de clients ou d'allocataires d'aides sociales, ces « écrits vers le travail » (Equoy-Hutin, 2003, 2006), en tant qu'il s'inscrivent dans un projet argumentatif (Amossy, 2000) affirmé de la part du citoyen scripteur, détiennent, révèlent et construisent des dimensions qui dépassent ce projet initial et participent de l'inscription et la participation du citoyen à la société contemporaine. Cette communication en Analyse de discours (Maingueneau, 1991, 1995, 2005) ambitionne d'extraire de ces courriers spontanés et des comportements sociolangagiers qui s'y révèlent, les dimensions sociales, historiques, culturelles, idéologiques et doxiques (Amossy) qui les animent sur ce second plan de lecture (représentation de soi, du service public, de l'autorité institutionnelle, ...). En d'autres termes, cette observation d'écritures ordinaires (Fabre, 1991, 1997) permet en outre de montrer que, loin de s'opposer, « norme » et « écart » entretiennent des rapports qui ouvrent sur la richesse de ces écritures a priori exclusivement utilitaires et trop peu prises en considération.

Théories de la communication et nouvelles technologies de l'information et de la communication Laurent Lesavre Internet propose par sa technologie performante de nouveaux moyens de transmission. Les acteurs, utilisant ses moyens se trouvent-ils pour autant dans un nouveau contexte ? Les théories de la communication d'Aristote à nos jours permettent-elles de décrire, expliquer voire anticiper la communication sur Internet ? Communication de masse (5,9 millions d'Internautes en France), communication interpersonnelle (cybernétique), communication persuasive, Internet semble concentrer tous les aspects de la communication sur un seul moyen de transmission. Dans cet article, nous essaierons de clarifier par les théories de masse, interpersonnelles et de persuasion la richesse de l'outil, en nous appuyant sur l'exemple des bandeaux publicitaires. Pour conclure, nous constaterons que les anciennes théories (voire les anciens, Aristote en tête) conservent de bons pouvoirs explicatifs qu'il conviendra de préciser par une étude empirique afin de les rendre opérationnels et adaptés, à défaut de voir émerger de nouveaux concept

Étude de l'influence du polymorphisme de gènes de réparation de l'ADN par excision de nucléotides sur l'activité des agents anticancéreux François Moisan Mon sujet de thèse repose sur une observation initiale réalisée sur le panel de 60 lignées cellulaires tumorales humaines du National Cancer Institute (NCI) et concerne des polymorphismes de gènes impliqués dans la réponse aux agents anticancéreux, les gènes ERCC2 et ERCC5 ( à l'origine des protéines XPD et XPG) qui interviennent dans la réparation de l'ADN par le mécanisme du Nucléotide Excicion Repair (NER). Nous avons identifié une association entres ces polymorphismes et la cytotoxicité in vitro d'agents anticancéreux, en particulier celle des taxanes. A partir de ce travail initial, nos recherches se sont établies dans deux directions : (1) une approche clinique visant à chercher un lien significatif entre ces deux polymorphismes et la sensibilité aux taxanes chez des patients traités par chimiothérapie; (2) une approche biochimique visant à comprendre les mécanismes moléculaires expliquant l'association entre ces deux polymorphismes et la sensibilité cellulaire aux taxanes. Ce travail a permis de montrer que le niveau d'expression de ERCC2 modifié par le polymorphisme du codon 751, ainsi que la variation protéique entrainée par le polymorphisme du codon 1104 de ERCC5, étaient impliqués dans la régulation du cycle cellulaire par modification de l'activité CDK1. La réponse au paclitaxel se trouve ainsi modifiée du fait de ce mécanisme. A défaut d'être définitifs, nos résultats de l'étude clinique sont encourageants et montrent une tendance à une probabilité de réponse plus élevée chez les patientes de génotype ERCC2 homozygote variant et chez les patientes de génotype ERCC5 homozygote sauvage ou hétéroygote lorsque la chimiothérapie contient un taxane, le docetaxel.

Interaction entre des mutants hrp d'Erwinia amylovora, agent du feu bactérien, le parent pathogène et la plante hôte : recherche de mécanismes modulant la compatibilité Sophie Cesbron Le feu bactérien des Maloideae est provoqué par Erwinia amylovora, gamma-protéobactérie dont le pouvoir pathogène repose un système de sécrétion de type trois (T3SS). Des travaux antérieurs ont révélés que des mutants hrp de régulation de ce système (hrpL, hrpS), avirulents, sont capables de protéger la plante d'une infection par la souche sauvage. Nous avons d'abord voulu savoir si la protection est due à une induction de défenses chez la plante. L'étude de l'expression de gènes de défense dépendants des voies de l'acide salicylique, de l'acide jasmonique, de l'éthylène et des phénylpropanoïdes montre qu'aucune de ces voies n'est particulièrement induite par les mutants de régulation. Puis après avoir écarté l'hypothèse d'un effet direct des mutants sur la souche sauvage, nous avons recherché des différences au niveau protéique et surtout transcriptomique entre ces bactéries par des démarches avec et sans a priori (gènes-cibles vs cDNAAFLP). Les résultats montrent que HrpS et HrpL sont capables de réguler différentiellement d'autres gènes que les gènes hrp : HrpL régule négativement les gènes flagellaires, le chimiotactisme et un gène du GSP, et positivement un gène du T1SS et une OMP ; HrpS régule négativement le quorum sensing et positivement un gène potentiellement impliqué dans la synthèse de l'éthylène. Nous avons particulièrement approfondi le système flagellaire d'E. amylovora. Une analyse bioinformatique a révélé que cette bactérie possède deux systèmes flagellaires, secrétant deux flagellines distinctes (32 vs 50 KDa). La flagelline de 32 KDa, réprimée par HrpL, ne joue pas de rôle majeur dans la protection et ne possède pas l'épitope flg22 impliqué dans l'immunité des plantes. Si notre travail n'élucide pas complètement l'origine de la protection conférée par les mutants de régulation, il apporte des informations nouvelles sur E. amylovora et sur la régulation de certains de ses gènes au cours de l'interaction avec son hôte.

Burn-induced oxidative stress is altered by a low zinc status: kinetic study in burned rats fed a low zinc diet. Richard Claeyssen et al. As an initial subdeficient status of zinc, considered as an essential antioxidant trace element, is frequent in burned patients, we aim to assess the effects of low zinc dietary intakes on burn-induced oxidative stress, in an animal model. After 8 weeks of conditioning diets containing 80 ppm (control group) or 10 ppm of zinc (depleted group), Wistar rats were 20% TBSA burned and sampled 1-10 days after injury. Kinetic evolutions of zinc status, plasma oxidative stress parameters, and antioxidant enzymes were also studied in blood and organs. The zinc-depleted diet induced, before injury, a significant decrease in zinc bone level and the increase of oxidative stress markers without stimulation of antioxidant enzyme activity. After burn, more markedly in zinc depleted animals than in controls, zinc levels decreased in plasma and bone, while increasing in liver. The decrease of thiol groups and GSH/GSSG ratio and the depression of GPx activity in liver are also moderately emphasized. Nevertheless, depleted zinc status could not be considered as determining for oxidative damages after burn injury. Further investigations must also be done to enlighten the mechanism of beneficial effects of zinc supplementation reported in burned patients.

On the relevance of the dam break problem in the context of nonlinear shallow water equations Denys Dutykh et al. The classical dam break problem has become the de facto standard in validating the Nonlinear Shallow Water Equations (NSWE) solvers. Moreover, the NSWE are widely used for flooding simulations. While applied mathematics community is essentially focused on developing new numerical schemes, we tried to examine the validity of the mathematical model under consideration. The main purpose of this study is to check the pertinence of the NSWE for flooding processes. From the mathematical point of view, the answer is not obvious since all derivation procedures assumes the total water depth positivity. We performed a comparison between the two-fluid Navier-Stokes simulations and the NSWE solved analytically and numerically. Several conclusions are drawn out and perspectives for future research are outlined.

A local limit theorem for random walks in random scenery and on randomly oriented lattices Fabienne Castell et al. Random walks in random scenery are processes defined by $Z_n:=\sum_{k=1}^n\xi_{X_1+...+X_k}$, where $(X_k,k\ge 1)$ and $(\xi_y,y\in\mathbb Z)$ are two independent sequences of i.i.d. random variables. We assume here that their distributions belong to the normal domain of attraction of stable laws with index $\alpha\in (0,2]$ and $\beta\in (0,2]$ respectively. These processes were first studied by H. Kesten and F. Spitzer, who proved the convergence in distribution when $\alpha\neq 1$ and as $n\to \infty$, of $n^{-\delta}Z_n$, for some suitable $\delta>0$ depending on $\alpha$ and $\beta$. Here we are interested in the convergence, as $n\to \infty$, of $n^\delta{\mathbb P}(Z_n=\lfloor n^{\delta} x\rfloor)$, when $x\in \RR$ is fixed. We also consider the case of random walks on randomly oriented lattices for which we obtain similar results.

Approximations hybrides de processus de Markov à sauts multi-échelles : applications aux modèles de réseaux de gènes en biologie moléculaire Alina Crudu L'objectif principal de cette thèse a été de développer des nouveaux outils mathématiques pour l'étude des phénomènes stochastiques en biologique moléculaire. Les modèles mathématiques pour la dynamique stochastique des réseaux de réactions biochimiques sont basés sur les processus de Markov à sauts. On propose des approximations hybrides pour les processus de Markov à sauts multi-échelles. En utilisant comme argument heuristique un développement limité du générateur du processus à sauts (procédé connu en chimie et en physique sous le nom de développement de Kramers-Moyal) nous identifions plusieurs types d'asymptotiques hybrides : processus déterministes par morceaux et diffusions hybrides. Le développement de Kramers-Moyal permet d'obtenir de manière systématique des modèles hybrides, qui sont simulés par la suite avec des algorithmes adaptés. Les approximations déterministes par morceaux sont étudiées avec des méthodes mathématiques rigoureuses. On montre la convergence faible du processus de Markov à sauts vers deux types de processus déterministes par morceaux : avec et sans sauts dans les variables continues. Les approximations hybrides peuvent être simplifiées davantage en utilisant des méthodes de moyennisation. On propose aussi quelques résultats dans cette direction.

Axisymmetric solitary waves on the surface of a ferrofluid Elise Bourdin et al. We report the first observation of axisymmetric solitary waves on the surface of a cylindrical magnetic fluid layer surrounding a current-carrying metallic tube. According to the ratio between the magnetic and capillary forces, both elevation and depression solitary waves are observed with profiles in good agreement with theoretical predictions based on the magnetic analogue of the Korteweg-deVries equation. We also report the first measurements of the velocity and the dispersion relation of axisymmetric linear waves propagating on the cylindrical ferrofluid layer that are found in good agreement with theoretical predictions.

How to characterize the dynamics of cold atoms in non dissipative optical lattices? Daniel Hennequin et al. We examine here the classical dynamics of cold atoms in square optical lattices, i.e. lattices obtained with two orthogonal stationary plane waves. Contrary to much of the past studies in this domain, the potential is here time independent and non dissipative. We show that, as a function of the experimental parameters, very different behaviors are obtained, both for the dynamics of atoms trapped inside individual sites, and for atoms travelling between sites: inside the sites, chaos may be a main regime or, on the contrary, may be negligible; outside the sites, chaos sometimes coexists with other regimes. We discuss what are the consequences of these differences on the macroscopic behavior of the atoms in the lattice, and we propose experimental measurements able to characterize these dynamics and to distinguish between the different cases.

Derivation of reduced two-dimensional fluid models via Dirac's theory of constrained Hamiltonian systems Cristel Chandre et al. We present a Hamiltonian derivation of a class of reduced plasma two-dimensional fluid models, an example being the Charney-Hasegawa-Mima equation. These models are obtained from the same parent Hamiltonian model, which consists of the ion momentum equation coupled to the continuity equation, by imposing dynamical constraints. It is shown that the Poisson bracket associated with these reduced models is the Dirac bracket obtained from the Poisson bracket of the parent model.

PRECIPITATION DU BORE DANS LE SILICIUM IMPLANTE ET REDISTRIBUTION DU BORE ET PLATINE LORS DE L'INTER-DIFFUSION REACTIVE DANS LES FILMS MINCES NICKEL/SILICIUM Oana Cojocaru-Miredin Ce travail de thèse est constitué de deux grandes parties. Dans la première partie, nous avons étudié la redistribution du bore dans le silicium (001), à l'ambiante et après recuit thermique, à l'aide de la sonde atomique tomographique (SAT), la microcopie électronique en transmission (MET) et la spectrométrie de masse d'ions secondaires (SIMS). Pour cette étude, le silicium a été fortement implanté en bore. La concentration en B dans le Si peut alors dépasser la limite de solubilité. On est donc dans le cas d'un système sursaturé. Dans ce cas, nous avons observé qu'à la formation de défauts (BIC's, défauts {113} etc...) s'ajoute la germination d'amas riches en B ou même la précipitation d'une nouvelle phase après recuit thermique. Dans la deuxième partie, nous avons étudié la redistribution du B et du Pt dans le NiSi, utilisé lors de la miniaturisation des transistors MOS, afin de réduire la résistance de contact. A part l'accumulation du bore à l'interface NiSi/Si et à la surface de NiSi, nous avons observé, la précipitation du bore dans le monosiliciure de nickel, pour un recuit à 450°C. En revanche, pour le platine nous n'observons plus un phénomène de précipitation. Il a plutôt tendance de ségréger aux interfaces à 290°C (observation du phénomène de "chasse-neige "), tandis qu'au delà de 350°C, le Pt s'accumule majoritairement dans la phase NiSi.

On the relevance of the dam break problem in the context of nonlinear shallow water equations Denys Dutykh et al. The classical dam break problem has become the de facto standard in validating the Nonlinear Shallow Water Equations (NSWE) solvers. Moreover, the NSWE are widely used for flooding simulations. While applied mathematics community is essentially focused on developing new numerical schemes, we tried to examine the validity of the mathematical model under consideration. The main purpose of this study is to check the pertinence of the NSWE for flooding processes. From the mathematical point of view, the answer is not obvious since all derivation procedures assumes the total water depth positivity. We performed a comparison between the two-fluid Navier-Stokes simulations and the NSWE solved analytically and numerically. Several conclusions are drawn out and perspectives for future research are outlined.

Review of Self-potential methods in Hydrogeophysics Laurence Jouniaux et al. The self-potential (SP) method is a passive geophysical method based on the natural occurrence of electrical fields on the Earth's surface. Combined with other geophysical methods, SP surveys are especially useful for localizing and quantifying groundwater flows and pollutant plume spreading, and estimating pertinent hydraulic properties of aquifers (water table, hydraulic conductivity). Laboratory experiments have shown that the involved coupling coefficients mainly depend on the fluid chemistry, conductivity and pH, and on the soil or rock properties. The interpretation of SP observations can be done qualitatively, for instance by correlation of SP gradients with water fluxes (through electrokinetics) or salt fluxes (through electro-diffusion). In recent years, the interpretation has been improved with the help of modelling or/and inversion of the Poisson equation and endeavours to estimate hydraulic parameters by means of the intensity of electric current sources caused by underground flows.

Bulles Spéculatives : Le Cas des Marchés Américain et Français Dominique Thevenin L'objet de cet article est d'analyser l'existence de bulles spéculatives rationnelles - c'est-à-dire l'existence d'écarts durables entre des cours boursiers efficients et leurs déterminants fondamentaux- sur les marchés américains et français, au cours de la période 1871-1996. L'intérêt est double. D'une part, les accidents spéculatifs, qui affectent de plus en plus souvent les marchés financiers, peuvent remettre en question l'argument majeur des gestionnaires de portefeuille, selon lequel les placements en actions sont les plus rentables à long terme. D'autre part, les études empiriques portent essentiellement sur le marché américain, et ne prennent pas en compte la forte hausse des cours des années 90. En général, elles ne rejettent pas les bulles. Il est donc utile de déterminer si le marché français est également affecté par des bulles. Les tests effectués sur les indices des marchés des deux pays permettent de dégager les trois conclusions suivantes: d'abord, le biais, en faveur du rejet des bulles, affecte aussi les tests de co-intégration en présence de bulle intrinsèque. Ensuite, les tests sur le marché américain ne rejettent jamais les bulles rationnelles. Leurs résultats sont plus nets lorsque la période d'observation inclut la hausse des cours des années 90. Enfin, le marché français laisse apparaître un comportement totalement différent: les tests rejettent en général l'existence de bulles rationnelles. Des écarts, non rationnels, entre les cours et les fondamentaux semblent cependant constatés. Des problèmes économétriques, ou des ruptures de processus peuvent être à l'origine de ces résultats

Private Equity investment performance : Do social ties between venture capitalists and CEOs matter Christophe Bonnet Our area of interest is the relationship between Private Equity professionals and the CEOs of companies. Building on previous research on board-CEO relationship and on venture capital and management buyout governance, we aim at complementing the frequently used agency theory perspective by way of a social and behavioural perspective. Whereas agency theorists underline the role of independence between management and board, we think the success of private equity professionals lies in their ability to combine independence and control with trust, cooperation and support in their relationship with CEOs. The existence of social ties between VCs and CEOs is expected to produce antagonistic consequences, fostering cooperation and support but hampering control. We propose an original model formalising the relations between VC-CEO social ties, board processes, VC's roles vis à vis CEOs, and investment performance.

Confiance et gouvernement des entreprises: le rôle de la confiance dans la relation capital-investisseurs et dirigeants et son influence sur la performance Christophe Bonnet Ce papier de recherche étudie l'influence du niveau de confiance interpersonnelle existant entre capital investisseurs et dirigeants d'entreprise sur trois types de variables : les processus d'interaction qui caractérisent leur relation, les rôles tenus par les capital investisseurs vis à vis des dirigeants dans la phase post-investissement, et, par l'intermédiaire de ces processus et rôles, sur la performance financière de l'investissement dans les entreprises concernées. Notre hypothèse centrale est que la confiance favorise les processus d'interaction et les rôles des capital investisseurs qui ont une influence positive sur la performance financière des entreprises, et donc sur celle de l'investissement qui a été opéré dans ces entreprises. Nous utilisons un cadre théorique éclectique (théorie de l'agence d'une part, théories de la confiance et de la coopération d'autre part) pour construire un modèle qui fait l'objet d'un test empirique au moyen d'une enquête par questionnaire sur un échantillon d'opérations de LBOs réalisés en France. Nos résultats montrent que le niveau de confiance interpersonnelle influe sur l'ensemble des processus d'interaction, ainsi que sur un nombre limité de rôles des capital investisseurs. Par contre ils ne mettent en évidence aucune relation directe entre confiance et performance financière de l'investissement.

On the relevance of the dam break problem in the context of nonlinear shallow water equations Denys Dutykh et al. The classical dam break problem has become the de facto standard in validating the Nonlinear Shallow Water Equations (NSWE) solvers. Moreover, the NSWE are widely used for flooding simulations. While applied mathematics community is essentially focused on developing new numerical schemes, we tried to examine the validity of the mathematical model under consideration. The main purpose of this study is to check the pertinence of the NSWE for flooding processes. From the mathematical point of view, the answer is not obvious since all derivation procedures assumes the total water depth positivity. We performed a comparison between the two-fluid Navier-Stokes simulations and the NSWE solved analytically and numerically. Several conclusions are drawn out and perspectives for future research are outlined.

Review of Self-potential methods in Hydrogeophysics Laurence Jouniaux et al. The self-potential (SP) method is a passive geophysical method based on the natural occurrence of electrical fields on the Earth's surface. Combined with other geophysical methods, SP surveys are especially useful for localizing and quantifying groundwater flows and pollutant plume spreading, and estimating pertinent hydraulic properties of aquifers (water table, hydraulic conductivity). Laboratory experiments have shown that the involved coupling coefficients mainly depend on the fluid chemistry, conductivity and pH, and on the soil or rock properties. The interpretation of SP observations can be done qualitatively, for instance by correlation of SP gradients with water fluxes (through electrokinetics) or salt fluxes (through electro-diffusion). In recent years, the interpretation has been improved with the help of modelling or/and inversion of the Poisson equation and endeavours to estimate hydraulic parameters by means of the intensity of electric current sources caused by underground flows.

Introduction review on cosmology with Type Ia supernovae Julien Guy In this short review, some key aspects of the cosmology with type Ia supernovae are discussed in light of the recent results of high redshift surveys. The interpretation of SNe colours, the impact of calibration and the recent developments in the tests for an evolution of the population with redshift are addressed.

Non asymptotic minimax rates of testing in signal detection with heterogeneous variances Béatrice Laurent et al. The aim of this paper is to establish non-asymptotic minimax rates of testing for goodness-of-fit hypotheses in a heteroscedastic setting. More precisely, we deal with sequences $(Y_j)_{j\in J}$ of independent Gaussian random variables, having mean $(\theta_j)_{j\in J}$ and variance $(\sigma_j)_{j\in J}$. The set $J$ will be either finite or countable. In particular, such a model covers the inverse problem setting where few results in test theory have been obtained. The rates of testing are obtained with respect to $l_2$ and $l_{\infty}$ norms, without assumption on $(\sigma_j)_{j\in J}$ and on several functions spaces. Our point of view is completely non-asymptotic.

Adaptive asymptotically efficient estimation in heteroscedastic nonparametric regression Leonid Galtchouk et al. The paper deals with asymptotic properties of the adaptive procedure proposed in the author paper, 2007, for estimating an unknown nonparametric regression. %\cite{GaPe1}. We prove that this procedure is asymptotically efficient for a quadratic risk, i.e. the asymptotic quadratic risk for this procedure coincides with the Pinsker constant which gives a sharp lower bound for the quadratic risk over all possible estimates

Sharp non-asymptotic oracle inequalities for nonparametric heteroscedastic regression models Leonid Galtchouk et al. An adaptive nonparametric estimation procedure is constructed for heteroscedastic regression when the noise variance depends on the unknown regression. A non-asymptotic upper bound for a quadratic risk (oracle inequality) is obtained